使用slurm job id

Question

当我在集群上启动计算时，我通常会有一个单独的程序在最后进行后处理：

sbatch simulation
sbatch --dependency=afterok:JOBIDHERE postprocessing

我想避免错误输入并自动插入好的作业ID。任何的想法？感谢

Answer 1

您可以这样做：

RES=$(sbatch simulation) && sbatch --dependency=afterok:${RES##* } postprocessing

RES变量将保存sbatch命令的结果，类似于Submitted batch job 102045。构造${RES##* }隔离最后一个单词（参见更多信息here），在当前情况下是作业ID。 &&部分确保您在第一次提交失败时不尝试提交第二个作业。