我正在我的大学建立一个小型的256核心计算集群，用于流体动力学模拟。我们使用的代码是用C和Fortran混合编写的，目前在大型超级计算机上运行就好了。
在我们的集群开发中，我们有16个计算节点，每个节点有16个AMD CPU。我们还有一个8核戴尔盒子，我们想用它作为“头”或“登录”节点。不过，这个盒子是Intel Xenon。
我们希望将每个用户的主目录NFS挂载到登录节点，并限制他们对计算节点的访问。这将要求用户通过登录节点上的mpirun编译和运行他们的程序。我们的问题是：
如果那里有一个可以提供帮助的好资源，我们也会很感激。我们在各个页面上找到了很多建议和想法......很高兴被指向一个社区认为有信誉的人。 （免责声明......我们不是计算机科学家，我们只是常规科学家。）
答案 0 :(得分：1)
英特尔和AMD处理器具有很大的二进制兼容性，但是如果代码是针对英特尔的优化编译的话，那么高速缓存大小和指令调度之间的差异会导致AMD上特定代码的次优运行，反之亦然。两家供应商实施的指令集存在一些差异，但这些指标在科学计算方面通常都不是很有用。
由于（1）不是问题，因此不需要解决方法。还有一点必须记住，一些编译器默认为处理器启用指令集和优化，编译代码。因此，当头节点使用来自不同供应商的CPU或甚至来自同一供应商但来自不同代的CPU时，必须特别注意编译器选项。对于英特尔的编译器套件尤其如此，而GCC默认情况下不那么激进。另一方面，人们通常可以指示编译器定义和优化的架构，例如，通过向GCC提供适当的-mtune=...选项。
至于共享文件系统，它取决于数据存储的组织方式。并行应用程序通常需要访问所有级别的相同文件（例如配置文件，数据库等），因此需要共享主文件系统和工作文件系统（除非使用主文件系统作为工作文件系统）。此外，您可能希望共享诸如/opt之类的内容（或存储群集范围软件包的任何位置），以简化群集管理。
由于世界各地的集群安装有尽可能多的“最佳实践”，因此很难将您指向一个明确的来源。只需坚持使用工作设置并迭代调整，直到达到收敛。安装TORQUE是一个好的开始。