使用gff文件创建一个字符数组

Question

有人可以帮我创建一个包含这类数据的“字符数组”： ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/Bacteria/Escherichia_coli_ATCC_8739_uid58783/NC_010468.gff

我们的合作者的指示：

可以通过输入gff = {}将gff文件复制并粘贴到字符数组中，然后复制并“粘贴Excel数据”

但我可以以某种方式将其保存为单元格数组，因此下游脚本无法正常运行。

其他信息 我需要在.m脚本（我从别人那里得到）中使用.gff文件来解析我的序列。 以下是我认为与我的问题相关的脚本部分：

genelist=gff(:,3);
starts=gff(:,4);
ends=gff(:,5);
names=gff(:,9);
genelogical=strncmp('gene',genelist,4);

因此我希望9列包含以下信息： 1. seqID; 来源; 3.类型; 4和5。开始和结束; 6.得分; 7. strand; 8.阶段 9.属性

此外，当我将单元格数组保存为“单元格”时，并尝试通过键入

将其转换为字符数组

char(cell)

我收到此错误消息： 单元格元素必须是字符数组 所以猜猜这​​不起作用......

编辑

任何人都有任何想法？

谢谢， 乔伊斯

Answer 1

您给出的说明是指可从“变量”编辑器访问的以下上下文菜单项：

首先，在命令行gff={};运行以生成一个空的cell数组。然后双击“工作区”选项卡中的gff变量以获取上述编辑器窗口。单击表格左上角的方形regino选择所有单元格，然后右键单击以显示所显示的菜单，并粘贴数据。如果粘贴工作正常（实际上可能需要几分钟 - 检查CPU使用率），您应该得到以下结果：

然后你发布的命令工作。 strncmp明确表示需要单元格数组。