假设我正在开发一个名为foo
的包,它希望使用description
包中的memisc
函数。我不想导入整个memisc
命名空间,因为:
memisc
会覆盖基本aggregate.formula
函数,这会破坏一些内容。例如,example(aggregate)
会悲惨地失败。该软件包包含以下文件:
说明
Package: foo
Version: 0.0
Title: Foo
Imports:
memisc
Collate:
'foo.R'
NAMESPACE
export(bar)
importFrom(memisc,description)
R / foo.R
##' bar function
##'
##' @param x something
##' @return nothing
##' @importFrom memisc description
##' @export
`bar` <- function(x) {
description(x)
}
我认为使用importFrom
不会加载整个memisc
命名空间,而只会加载namespace::description
,但事实并非如此。从香草R开始:
R> getS3method("aggregate","formula")
## ... function code ...
## <environment: namespace:stats>
R> library(foo)
R> getS3method("aggregate","formula")
## ... function code ...
## <environment: namespace:memisc>
R> example(aggregate)
## Fails
那么,您知道如何在description
导入memisc
函数而不在我的环境中获取aggregate.formula
吗?
答案 0 :(得分:25)
你不能。
如果在memisc
字段中声明Imports:
,则在加载包时将加载命名空间,并且包可以找到导出的对象。 (如果在Depends:
中指定它,则命名空间将被加载并附加到搜索路径,这使得任何代码都可以找到导出的对象。)
加载命名空间的一部分是使用泛型注册方法。 (我看了但是找不到一个说明这一点的规范文档;我将呼吁将函数声明为NAMESPACE
文件中的S3方法作为证据。)定义的方法与泛型保持一致泛型函数(或者,可能是泛型函数的命名空间)的可见性。
通常,包将为其创建的泛型或其定义的类定义方法。 S3对象系统没有正式定义S3类(或者创建类的包)的机制,但一般的想法是如果包定义了返回具有该类属性的对象的函数(并且是唯一的包),那个类就是那个包的类。如果这两个条件中的任何一个成立,就不会有问题。如果在包中定义了泛型,则只有在附加包时才能找到它;如果在包中定义了类,那么只有在附加和使用包时,该类的对象才会存在(因此会被调度)。
在memisc
示例中,两者都不成立。 aggregate
通用在stats
包中定义,formula
对象也在stats
包中定义(基于定义as.formula
,{{ 1}}等等)因为它既不是[.formula
的通用也不是memisc
的对象,如果memisc
只是简单的话,甚至可以看到效果(以及调派的方法)已加载但未附加。
有关此问题的另一个示例,但使用memisc
,请参阅Reordering factor gives different results, depending on which packages are loaded。
通常,将包方法不能控制对象或泛型的泛型方法添加到一起是不好的做法;如果它覆盖了核心包中的方法,那么加倍;如果它不是核心包中现有功能的向后兼容功能,那就非常了。
对于您的示例,您可能最好将reorder.factor
的代码复制到您的包中,尽管该方法有其自身的问题和警告。
答案 1 :(得分:2)
有一点需要注意,我不太熟悉R环境和命名空间,也不知道这是否适用于包 - 我在编程中使用的解决方法是使用::
来将该函数复制到我自己的函数中。
加载整个软件包可能会产生未知的后果,正如对OP的问题的评论中所讨论的那样,但它似乎没有将软件包的函数名称附加到R名称空间并掩盖现有的函数名称。
例:
my_memisc_description <- memisc::description