具有访问器功能的分段故障

时间:2013-11-07 01:20:36

标签: c++ class segmentation-fault accessor

我正在练习C ++,并创建了一个类,用于存储从快速格式读取的序列及其名称。代码如下:

#include<fstream>
#include<iostream>
#include<string>
#include<vector>

using namespace std;

class Sequence {
    vector<string> fullSequence, sequenceNames;

public:
    void fastaRead(string fileName);
    string getSequence(int index);

};

string Sequence::getSequence(int index)
{
    return fullSequence[index];
}


void Sequence::fastaRead(string fileName)
{
    vector<string> fullSequence, sequenceNames;
    ifstream inputFile;
    inputFile.open(fileName);
    if (inputFile.is_open()) {
        string currentSeq;
        string line;
        bool newseq = false;
        while (getline(inputFile, line))
        {
            if (line[0] == '>') {
                sequenceNames.push_back(line.substr(1,line.size()));
                newseq = true;
            } else {
                if (newseq == true) {
                    fullSequence.push_back(currentSeq);
                    currentSeq = line;
                    newseq = false;
                } else {
                    currentSeq.append(line);
                }
            }
        }
    }
    inputFile.close();
}


int main()
{
    Sequence inseq;
    cout << "Fasta Sequence Filepath" << endl;
    string input;
    getline(cin, input);
    inseq.fastaRead(input);
    inseq.getSequence(0);
    return 0;
}

但是,当我使用以下虚拟输入文件运行程序时:

>FirstSeq
AAAAAAAAAAAAAA
BBBBBBBBBBBBBB
>SecondSeq
TTTTTTTTTTTTTT
>ThirdSequence
CCCCCCCCCCCCCC
>FourthSequence
GGGGGGGGGGGGGG

调用行inset.getSequence(0)时出现分段错误。我做了什么导致了seg故障,我如何确保它不会发生?我知道它可能与指针中的错误有关,但我认为我没有使用指针,如果我没记错,需要*字符。

谢谢, 本。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您需要删除void vector<string> fullSequence, sequenceNames;函数中的Sequence::fastaRead。当您在该函数中定义这些变量并使用它们时,您不会访问类中具有相同名称的变量,而是访问您在该函数中定义的局部变量,除非您在{{1}之前添加它们。访问时。

类中的变量实际上是空的,并且您会遇到分段错误。