如何在不知道Rcpp类型的情况下处理向量

时间:2013-11-06 22:12:49

标签: r rcpp

我想在Rcpp中复制以下R函数:

fR = function(x) x[1:2]

fR(c(1,2,3))
#[1] 1 2
fR(c('a','b','c'))
#[1] "a" "b"

我可以为固定输出类型执行此操作:

library(inline)
library(Rcpp)

fint = cxxfunction(signature(x = "SEXP"), '
          List xin(x);
          IntegerVector xout;

          for (int i = 0; i < 2; ++i) xout.push_back(xin[i]);

          return xout;', plugin = "Rcpp")

但这只适用于整数,如果我尝试将xout类型替换为List(或GenericVector,它们是相同的) - 它适用于任何输入类型,但是我找回list而不是矢量。

这样做的正确Rcpp方式是什么?

2 个答案:

答案 0 :(得分:9)

请勿在{{1​​}}类型上使用push_back。当前实现Rcpp向量的方式需要每次都复制所有数据。这是一项非常昂贵的操作。

我们有RCPP_RETURN_VECTOR用于调度,这要求您编写一个模板函数,将Vector作为输入。

Rcpp

只需sourceCpp这个文件,这也将运行调用这两个函数的R代码。实际上,模板可能更简单,这也可以工作:

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp ;

template <int RTYPE>
Vector<RTYPE> first_two_impl( Vector<RTYPE> xin){
    Vector<RTYPE> xout(2) ;
    for( int i=0; i<2; i++ ){
        xout[i] = xin[i] ;    
    }
    return xout ;
}

// [[Rcpp::export]]
SEXP first_two( SEXP xin ){
  RCPP_RETURN_VECTOR(first_two_impl, xin) ;
}

/*** R
    first_two( 1:3 )
    first_two( letters )
*/

模板参数template <typename T> T first_two_impl( T xin){ T xout(2) ; for( int i=0; i<2; i++ ){ xout[i] = xin[i] ; } return xout ; } 只需要:

  • 构建者采用T
  • int

或者,这可能是dplyr矢量访问者的工作。

operator[](int)

访问者允许您在向量上执行一组操作,而不管其包含的数据类型。

#include <dplyr.h>
// [[Rcpp::depends(dplyr,BH)]]

using namespace dplyr ;
using namespace Rcpp ;

// [[Rcpp::export]]
SEXP first_two( SEXP data ){
    VectorVisitor* v = visitor(data) ;
    IntegerVector idx = seq( 0, 1 ) ;
    Shield<SEXP> out( v->subset(idx) ) ;
    delete v ;
    return out ;
}

答案 1 :(得分:0)

你需要选择一种类型(即不要使用signature="SEXP" [哦,无论如何你应该查看属性])。

或者您保留SEXP类型,并在内部发送。请参阅示例this post on the Rcpp Gallery

编辑:而C当然是静态输入的。这些非常依赖于类型的开关也遍布R源。这里没有免费的午餐。