我想在Rcpp
中复制以下R函数:
fR = function(x) x[1:2]
fR(c(1,2,3))
#[1] 1 2
fR(c('a','b','c'))
#[1] "a" "b"
我可以为固定输出类型执行此操作:
library(inline)
library(Rcpp)
fint = cxxfunction(signature(x = "SEXP"), '
List xin(x);
IntegerVector xout;
for (int i = 0; i < 2; ++i) xout.push_back(xin[i]);
return xout;', plugin = "Rcpp")
但这只适用于整数,如果我尝试将xout
类型替换为List
(或GenericVector
,它们是相同的) - 它适用于任何输入类型,但是我找回list
而不是矢量。
这样做的正确Rcpp
方式是什么?
答案 0 :(得分:9)
请勿在{{1}}类型上使用push_back
。当前实现Rcpp向量的方式需要每次都复制所有数据。这是一项非常昂贵的操作。
我们有RCPP_RETURN_VECTOR用于调度,这要求您编写一个模板函数,将Vector作为输入。
Rcpp
只需sourceCpp这个文件,这也将运行调用这两个函数的R代码。实际上,模板可能更简单,这也可以工作:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp ;
template <int RTYPE>
Vector<RTYPE> first_two_impl( Vector<RTYPE> xin){
Vector<RTYPE> xout(2) ;
for( int i=0; i<2; i++ ){
xout[i] = xin[i] ;
}
return xout ;
}
// [[Rcpp::export]]
SEXP first_two( SEXP xin ){
RCPP_RETURN_VECTOR(first_two_impl, xin) ;
}
/*** R
first_two( 1:3 )
first_two( letters )
*/
模板参数template <typename T>
T first_two_impl( T xin){
T xout(2) ;
for( int i=0; i<2; i++ ){
xout[i] = xin[i] ;
}
return xout ;
}
只需要:
T
int
或者,这可能是dplyr矢量访问者的工作。
operator[](int)
访问者允许您在向量上执行一组操作,而不管其包含的数据类型。
#include <dplyr.h>
// [[Rcpp::depends(dplyr,BH)]]
using namespace dplyr ;
using namespace Rcpp ;
// [[Rcpp::export]]
SEXP first_two( SEXP data ){
VectorVisitor* v = visitor(data) ;
IntegerVector idx = seq( 0, 1 ) ;
Shield<SEXP> out( v->subset(idx) ) ;
delete v ;
return out ;
}
答案 1 :(得分:0)
你需要选择一种类型(即不要使用signature="SEXP"
[哦,无论如何你应该查看属性])。
或者您保留SEXP
类型,并在内部发送。请参阅示例this post on the Rcpp Gallery。
编辑:而C当然是静态输入的。这些非常依赖于类型的开关也遍布R源。这里没有免费的午餐。