在R中一次对齐多个动物园对象

时间:2013-10-15 20:49:43

标签: r zoo

考虑以下动物园对象:

 x <- data.frame(Date = seq(as.Date("2013-02-01"), length=6, by="1 month") - 1, x = seq(6))
 y <- data.frame(Date = seq(as.Date("2013-02-01"), length=4, by="1 month"), y = seq(4))
 z <- data.frame(Date = seq(as.Date("2012-11-01"), length=9, by="1 month"), z = seq(9))

 x.zoo = zoo(x[,-1], order.by = x[,1])
 y.zoo = zoo(y[,-1], order.by = y[,1])
 z.zoo = zoo(z[,-1], order.by = z[,1])

请注意,3个动物园对象具有不同的长度。 我想将所有对象与变量“x”的日期对齐:换句话说,我想创建一个包含Date列(对象x的索引)的新数据帧,以及用最接近的可用观察值填充每个变量。

以下是我要找的结果:

         Date x  y  z
 1 2013-01-31 1  1  4
 2 2013-02-28 2  2  5
 3 2013-03-31 3  3  6
 4 2013-04-30 4  4 NA
 5 2013-05-31 5 NA NA
 6 2013-06-30 6 NA NA

请注意,实际上,我有10个要与x对齐的变量。 我知道na.locf包中的函数zoo,但我不确定如何在多个动物园对象的上下文中对其进行调整。

无论如何我能有效地做到这一点吗?

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:5)

试试这个:

xx.zoo <- aggregate(x.zoo, as.yearmon)
yy.zoo <- aggregate(y.zoo, as.yearmon)
zz.zoo <- aggregate(z.zoo, as.yearmon)
out <- merge(x = xx.zoo, y = yy.zoo, z = zz.zoo, all = c(TRUE, FALSE, FALSE))

或者如果您不想写出来:

L <- setNames(list(x.zoo, y.zoo, z.zoo), c("x", "y", "z"))
all. <- c(TRUE, rep(FALSE, length(L) - 1))  # all FALSE except first
out <- do.call(merge, c(lapply(L, aggregate, as.yearmon), all = list(all.)))

给出:

> out
         x  y z
Jan 2013 1 NA 3
Feb 2013 2  1 4
Mar 2013 3  2 5
Apr 2013 4  3 6
May 2013 5  4 1
Jun 2013 6 NA 2

单位时间可能更合适,但如果对您来说重要的是时间与x.zoo次相同,那么请添加以下内容:

time(out) <- time(x.zoo)

更新:小改进。

答案 1 :(得分:1)

另一种选择,使用@Ricardo Saporta建议的round_date

library(lubridate)

# round dates in x.zoo to nearest month
index(x.zoo) <- round_date(index(x.zoo), "month")

# merge
xyz <- merge(x = x.zoo, y = y.zoo, z = z.zoo, all = c(TRUE, FALSE, FALSE))

# make data frame from original x dates and data from zoo object
data.frame(Date = x$Date, coredata(xyz))

#         Date x  y z
# 1 2013-01-31 1  1 4
# 2 2013-02-28 2  2 5
# 3 2013-03-31 3  3 6
# 4 2013-04-30 4  4 7
# 5 2013-05-31 5 NA 8
# 6 2013-06-30 6 NA 9