Question

我正在使用

p = VN.vtk_to_numpy(data.GetCellData().GetArray('p'))

从这样写的.vtk文件中读取3D标量：

p_x1y1z1 p_x2y1z1 p_x3y1z1 p_x4y1z1 p_x1y2z1 p_x2y2z1 p_x3y2z1 p_x4y2z1

依此类推，包含x，y和z的循环。

我想用这些数据填充3D numpy数组（它是一个常规网格），类似p(i,j,k)=p_ijk，所以我可以使用numpy工具箱中的渐变和其他运算符。

有什么想法吗？

问候

Answer 1

如果我理解你的情况，你可以reshape。

In [132]: p = np.array("p_x1y1z1 p_x2y1z1 p_x3y1z1 p_x4y1z1 p_x1y2z1 p_x2y2z1 p_x3y2z1 p_x4y2z1".split())

In [133]: p
Out[133]: 
array(['p_x1y1z1', 'p_x2y1z1', 'p_x3y1z1', 'p_x4y1z1', 'p_x1y2z1', 'p_x2y2z1', 'p_x3y2z1', 'p_x4y2z1'], 
      dtype='|S8')

在我看来，你的数组是在numpy调用'F'命令中排序的：

In [168]: p.reshape(4, 2, order='F')
Out[168]: 
array([['p_x1y1z1', 'p_x1y2z1'],
       ['p_x2y1z1', 'p_x2y2z1'],
       ['p_x3y1z1', 'p_x3y2z1'],
       ['p_x4y1z1', 'p_x4y2z1']], 
      dtype='|S8')

如果您还有z方差，只需重塑为三维：

In [169]: q
Out[169]: 
array(['p_x1y1z1', 'p_x2y1z1', 'p_x3y1z1', 'p_x4y1z1', 'p_x1y2z1',
       'p_x2y2z1', 'p_x3y2z1', 'p_x4y2z1', 'p_x1y1z2', 'p_x2y1z2',
       'p_x3y1z2', 'p_x4y1z2', 'p_x1y2z2', 'p_x2y2z2', 'p_x3y2z2',
       'p_x4y2z2', 'p_x1y1z3', 'p_x2y1z3', 'p_x3y1z3', 'p_x4y1z3',
       'p_x1y2z3', 'p_x2y2z3', 'p_x3y2z3', 'p_x4y2z3'], 
      dtype='|S8')

In [170]: q.reshape(4,2,3,order='F')
Out[170]: 
array([[['p_x1y1z1', 'p_x1y1z2', 'p_x1y1z3'],
        ['p_x1y2z1', 'p_x1y2z2', 'p_x1y2z3']],

       [['p_x2y1z1', 'p_x2y1z2', 'p_x2y1z3'],
        ['p_x2y2z1', 'p_x2y2z2', 'p_x2y2z3']],

       [['p_x3y1z1', 'p_x3y1z2', 'p_x3y1z3'],
        ['p_x3y2z1', 'p_x3y2z2', 'p_x3y2z3']],

       [['p_x4y1z1', 'p_x4y1z2', 'p_x4y1z3'],
        ['p_x4y2z1', 'p_x4y2z2', 'p_x4y2z3']]], 
      dtype='|S8')

这假设x,y,z应该映射到i+1,j+1,k+1，如下所示：

In [175]: r = q.reshape(4,2,3,order='F')

In [176]: r[0]   #all x==1
Out[176]: 
array([['p_x1y1z1', 'p_x1y1z2', 'p_x1y1z3'],
       ['p_x1y2z1', 'p_x1y2z2', 'p_x1y2z3']], 
      dtype='|S8')

In [177]: r[:,0]  # all y==1
Out[177]: 
array([['p_x1y1z1', 'p_x1y1z2', 'p_x1y1z3'],
       ['p_x2y1z1', 'p_x2y1z2', 'p_x2y1z3'],
       ['p_x3y1z1', 'p_x3y1z2', 'p_x3y1z3'],
       ['p_x4y1z1', 'p_x4y1z2', 'p_x4y1z3']], 
      dtype='|S8')

In [178]: r[:,:,0]  #all z==1
Out[178]: 
array([['p_x1y1z1', 'p_x1y2z1'],
       ['p_x2y1z1', 'p_x2y2z1'],
       ['p_x3y1z1', 'p_x3y2z1'],
       ['p_x4y1z1', 'p_x4y2z1']], 
      dtype='|S8')

numpy从索引列表创建3D数组

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