Question

在设置MonetDB并尝试将大型data.frame写为默认数据库（demo）中的新表后，我收到错误：

>dbWriteTable(conn, "table1", df)
Error in .local(conn, statement, ...) : 
   Unable to execute statement 'INSERT INTO table1 VALUES([...])

data.frame有尺寸：

>dim(df)
[1] 148767    618

并将所有列格式化为字符：

>all(lapply(df,class)=='character')
[1] TRUE

错误似乎源于字符串值太长（感谢@HannesMühleisen）：

>dbGetException(conn)
$errNum
[1] 22001

$errMsg
[1] "value too long for type (var)char(255)"

MonetDB如何设置新（VAR）CHAR变量的上限（我没有在文档的上界找到任何信息）？可以设置全局上限，还是可以通过MonetDB.R从R创建表时以交互方式设置上限？

Answer 1

可能是超时问题（dbConnect（）的参数）。如果您想调试，可以运行

assignInNamespace("DEBUG_IO",TRUE,"MonetDB.R")

连接前

如果你在这里发布输出，我可以让你更好地了解可能出现的问题。最后，您是否尝试过查看

的输出

dbGetException(conn)

更新：

很抱歉，原因是dbWriteTable对字符数据使用了错误的SQL类型。目前，使用VARCHAR（255），实际上限制为255个字符。应该使用的是STRING，它没有限制。它被指出是一个错误，将在下一个版本中修复。由于这可能需要一段时间，因此这是一种解决方法：如果从源代码安装，您可以通过更改

来解决此问题

setMethod("dbDataType", signature(dbObj="MonetDBConnection", obj = "ANY"), def=function(dbObj, obj, ...) {
        if (is.logical(obj)) "BOOLEAN"
        else if (is.integer(obj)) "INTEGER"
        else if (is.numeric(obj)) "DOUBLE PRECISION"
        else if (is.raw(obj)) "BLOB"

        else "VARCHAR(255)"
    }, valueClass = "character")

到

setMethod("dbDataType", signature(dbObj="MonetDBConnection", obj = "ANY"), def=function(dbObj, obj, ...) {
        if (is.logical(obj)) "BOOLEAN"
        else if (is.integer(obj)) "INTEGER"
        else if (is.numeric(obj)) "DOUBLE PRECISION"
        else if (is.raw(obj)) "BLOB"

        else "STRING"
    }, valueClass = "character")

在使用R CMD INSTALL安装软件包之前，在src / monetdb.R中

。 R-forge版本也将很快更新，在https://r-forge.r-project.org/R/?group_id=1534

查找版本0.8.1

在包MonetDB.R的dbWriteTable中，.local（conn，statement，...）中的错误可能是什么原因？

1 个答案: