MatLab错误：无法打开静态TLS

时间：2013-10-09 09:37:30

标签： matlab libraries lapack blas dlopen

几天以来，我在使用MATLAB时经常会收到同样的错误，这个错误发生在dlopen的某个时刻。我是MATLAB的新手，这就是为什么我不知道该怎么做。谷歌似乎也没有帮助我。当我尝试制作一个特征向量时，我得到了这个：

Error using eig
LAPACK loading error:
dlopen: cannot load any more object with static TLS

我在进行乘法时也得到了这个：

Error using  * 
BLAS loading error:
dlopen: cannot load any more object with static TLS

我当然找到了这个问题的解决方案，但我不太懂，也不知道该怎么做。这些是我找到的主题：

  1. How do I use the BLAS library provided by MATLAB?
  2. http://www.mathworks.de/de/help/matlab/matlab_external/calling-lapack-and-blas-functions-from-mex-files.html

    3. 有人能帮助我吗？

    演示此错误的函数调用示例

    >> randn(3,3)

ans =

 2.7694    0.7254   -0.2050             
-1.3499   -0.0631   -0.1241             
 3.0349    0.7147    1.4897            

>> eig(ans)

Error using eig
LAPACK loading error:
dlopen: cannot load any more object with static TLS

10 个答案:

答案 0 :(得分：103)

自R2012b（8.0）以来已知的MATLAB的bug no 961964。 MATLAB使用静态TLS动态加载一些库（线程本地存储，例如参见gcc编译器标志-ftls-model）。加载太多这样的libs =＆gt;没有空间了。

直到现在，mathwork的唯一解决方法是首先使用它们加载重要的（！）库（他们建议在startup.m中放置“ones（10）* ones（10）;”）。我最好不要对这个“解决方案策略”发表评论。

自R2013b（8.2.0.701）以及Linux x86_64以来，我的经验是：不要使用“doc”（图形帮助系统）！我认为这个doc-utility（libxul等）使用了很多静态TLS内存。

这是更新（2013/12/31）

所有以下测试均使用Fedora 20（使用glibc-2.18-11.fc20）和Matlab 8.3.0.73043（R2014a预发布）进行。

有关TLS的详细信息，请参阅 Ulrich Drepper，ELF处理线程局部存储，版本0.21,2013， 目前位于Akkadia和Redhat。

究竟发生了什么？

动态MATLAB（使用dlopen）加载几个需要初始化的库。所有这些库都需要dtv中的插槽（动态线程向量）。因为MATLAB在编译/链接时在运行时动态加载其中几个库，所以链接器（在mathworks上）没有机会计算所需的插槽（这是重要的部分）。现在，动态lib加载程序的任务是在运行时处理这种情况。但这并不容易。引用dl-open.c：

  

对于静态TLS，我们必须在这里分配内存   现在。这包括在DTV中分配内存。但我们   不能改变我们自己以外的任何DTV。所以，如果我们   不能保证我们没有DTV的空间   即使尝试也无法加载。

在glibc的动态lib加载器中有一个编译时常量（称为DTV_SURPLUS，请参阅glibc-source / sysdeps / generic / ldsodefs.h），用于为这样的混乱保留大量额外的插槽（使用静态TLS动态加载库）在多线程程序中）。在glibc-Version of Fedora 20中，这个值是14。

以下是我的案例中需要dtv插槽的第一个libs（运行MATLAB）：

matlabroot/bin/glnxa64/libut.so
/lib64/libstdc++.so.6
/lib64/libpthread.so.0
matlabroot/bin/glnxa64/libunwind.so.8
/lib64/libuuid.so.1
matlabroot/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
matlabroot/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/libfontmanager.so
matlabroot/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/libt2k.so
matlabroot/bin/glnxa64/mkl.so
matlabroot/sys/os/glnxa64/libiomp5.so
/lib64/libasound.so.2
matlabroot/sys/jxbrowser/glnxa64/xulrunner/xulrunner-linux-64/libxul.so
/lib64/libselinux.so.1
/lib64/libpixman-1.so.0
/lib64/libEGL.so.1
/lib64/libGL.so.1
/lib64/libglapi.so.0

是14以上=＆gt;太多了=＆gt; dtv中没有剩下的插槽。这就是错误消息试图告诉我们的内容，特别是数学。

记录：为了不违反MATLAB的许可，我没有调试，反编译或反汇编MATLAB附带的二进制文件的任何部分。我只调试了Fedora 20的free和open glibc-binaries，MATLAB用它来动态加载libs。

可以做些什么来解决这个问题？

有3种选择：

（a）中 重建MATLAB并不动态加载这些库 （使用initial-exec tls模型）而不是链接它们（然后链接器 可以计算所需的插槽！）

（b）中 重建这些库并确保它们不使用initial-exec tls模型。

（c）中 重建glibc并增加DTV_SURPLUS  的glibc / sysdeps /通用/ ldsodefs.h

显然，选项（a）和（b）只能由mathworks完成。

对于选项（c），不需要MATLAB源，因此可以在没有数学工作的情况下完成。

mathworks的状态是什么？

我真的试图向“MathWorks技术支持部门”解释这个问题。但我的印象是：他们不了解我。他们关闭了我的支持票，并在2014年1月与技术支持经理建议了电话（！）对话。

我会尽力解释这一点，但说实话：我不是很自信。

更新（2014/01/10）：目前mathworks正在尝试选项（b）。

更新（2014/03/19）：对于文件libiomp5.so，您可以在mathworks bug report 961964下载新编译的版本（无静态TLS）。还有其他的库？没有改善。所以不要惊讶于“dlopen：无法使用”doc“加载任何更多带有静态TLS的对象，例如见bug report 1003952。

答案 1 :(得分：27)

重启Matlab为我解决了这个问题。

答案 2 :(得分：6)

长话短说：在你启动matlab的目录中创建一个文件  startup.m，内容为ones(10)*ones(10);。重新启动matlab，它将被处理。

答案 3 :(得分：4)

http://www.mathworks.de/support/bugreports/961964已于2014年1月30日更新。 libiomp5.so附带了一个zip文件 我用Matlab R2013b在Mageia 4 x86_64上测试了它。 我现在可以使用Matlab文档打开一个没有任何问题的演示。

答案 4 :(得分：4)

正如我所发现的那样，MathWorks尚未解决这个古老的问题。

这是我的两分钱，对我有用（当我想要IT ++外部库时，使用MEX）。

让您找到的库是问题的原因“libXYZ.so”，并且您知道它在系统中的位置。

解决方案是通知MATLAB在其启动的最早时加载特定的库。出现此错误的原因显然是由于缺少此thread local storage又称tls目的的插槽（由于它们已被填满）。

因为最新的编译突然需要一个在启动时没有加载的新库，所以MATLAB会抛出这个错误。

遗憾的是，MATLAB从未关心这个问题。

幸运的是，解决方案是一个非常简单的终端命令。

linux-machine上的典型步骤应如下：

  1. 打开命令提示符（Ubuntu中的Ctrl+Alt+T）
  2. 发出以下命令
      

    export LD_PRELOAD =＆lt; PATH-TO-libxyz.so＆gt;

    3. 例如：export LD_PRELOAD=/usr/local/lib/libitpp.so

    1. 从同一终端启动matlab
        

      matlab＆amp;

      2. 现在运行程序应解决问题，就像我的情况一样。

      祝你好运！

      参考：

      [1] http://au.mathworks.com/matlabcentral/answers/125117-openmp-mex-files-static-tls-problem

答案 5 :(得分：3)

我有同样的问题，我想我刚解决了。

安装matlab时使用自定义安装（我第一次没有这样做）。选择在预定义文件夹（/ usr / local / bin）中创建指向matlab脚本的符号链接。这对我来说很有用！

答案 6 :(得分：3)

我对Matlab 2013b和Matlab 2014a都有同样的问题。 mathworks为libiomp5.so提供的修复只能解决LAPACK无法正常工作的问题。但是，我无法使用使用OpenMp的外部库（例如VL_FEAT）：我仍然收到错误 “dlopen：无法使用静态TLS加载任何其他对象。”

唯一对我有用的是降级到Matlab 2012b。

答案 7 :(得分：2)

我在＆＃34; bar＆＃34;之后遇到了这个问题。 （对于条形图）带有一个数组只给我一个蓝色块，没有抛出错误。重启首先解决了问题。但是在发生内存错误（处理一个非常大的文件之后）之后，我只是无法解决这个蓝色块问题。

使用＆＃34; hist＆＃34;在矩阵输入上给出了＆＃34; BLAS加载错误＆＃34;问题，并引导我到这个线程。 Mathwork解决方法修复了hist和bar问题。

只是想让人们认识到这个错误的影响程度。

答案 8 :(得分：0)

我有同样的问题并通过增加我的Java堆内存来解决它。转到首选项＆gt;一般＆gt; Java-Heap Memory，增加分配的内存。

答案 9 :(得分：0)

在R2013b / Ubuntu 12.04上，增加Java堆内存（至512 MB）也适用于我。当我处理一个11 GB的文件（16 GB RAM）时，“BLAS加载错误”开始了，并且在增加java堆内存并重新启动matlab后没有重现。

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