如何找出正在使用的功能(版本)?

时间:2013-10-08 22:18:51

标签: r debugging

问题:

如何找出正在调用哪个版本的函数?例如,如果我在data.frame上使用unique,我假设我使用的是unique.data.frame。但是,虽然有unique.raster,但没有raster::unique功能。但是,如果我使用trace(unique),我只会获得正在使用unique函数的信息。

我想确认,例如,当我致电unique(data.frame(1))时,正在调用unique.data.frame

示例:

我无法弄清楚为什么unique(raster_object)在命令行工作但不在函数内工作。显然,unique.default在函数内部被调用,所以我想明确说明哪个'唯一。&

例如,这有效:

library(raster)
a <- rasterFromXYZ(data.frame(a=1:2,b=2:3,c=3:4))
unique(a)

但是当我把它放在一个函数中时:

myfun <- function(){
  a <- rasterFromXYZ(data.frame(a=1:2,b=2:3,c=3:4))
  b <- crop(a, extent(c(1,2,3,4)))
  unique(a)
}

即使程序包使用raster作为依赖项,在构建程序包并将其加载到新的R会话后,我收到错误:

> myfun()
Error in unique.default(a) : unique() applies only to vectors

即使sessionInfo()显示已加载栅格包。

如果我使用debug(unique),它似乎没有告诉我调用哪个函数:

Browse[6]> unique(a)
Error in unique.default(a) : unique() applies only to vectors
Browse[6]> raster::unique(a)
debugging in: raster::unique(a)
debug: standardGeneric("unique")

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

 myfun <- function(){
   a <- rasterFromXYZ(data.frame(a=1:2,b=2:3,c=3:4))
   b <- crop(a, extent(c(1,2,3,4)))
   raster::unique(a)
 }
 myfun()
#[1] 3 4

如果在S3系统中调度unique.raster,您可以使用trace(unique),但由于类“rasterLayer”的unique方法是S4函数,因此赢了工作:

> showMethods("unique")
Function: unique (package base)
x="ANY", incomparables="ANY"
x="character", incomparables="missing"
    (inherited from: x="ANY", incomparables="ANY")
x="numeric", incomparables="missing"
    (inherited from: x="ANY", incomparables="ANY")
x="RasterLayer", incomparables="missing"
x="RasterStackBrick", incomparables="missing"

使用它的包裹位置:

> trace("unique", browser, where=raster)
Tracing function "unique" as seen from package "raster"
[1] "unique"
> myfun()
Tracing unique(xyz[, 1]) on entry 
Called from: eval(expr, envir, enclos)
Browse[1]> 
Browse[1]> c
[1] 3 4
> untrace()
Error in methods::.TraceWithMethods(where = <environment>, untrace = TRUE) : 
  argument "what" is missing, with no default
> untrace("unique",  where=raster)
Untracing function "unique" as seen from package "raster"