GGPLOT2;将不同数据集和栅格/矩阵数据中的点添加到spatialpolygonsdataframe的绘图中

Question

我尝试了这个但是我在eval（expr，envir，enclos）中得到了错误：找不到对象'组'。 pj4s是一个包含latlong投影的对象。

我的代码

fx.ggplot<-function(ctry,aesfill="id",scalefill="Country",pathcol="white"){
    #ctry is a shapefile of countries
     ctry@data$id = rownames(ctry@data)
    ctry.points = fortify(ctry, region="id")
    ctry.df = join(ctry.points, ctry@data, by="id")
    (txt<-paste("p<-ggplot(ctry.df) + aes(long,lat,group=group,fill=",aesfill,")"))
    eval(parse(text=txt))
    p<-p+   geom_polygon() +
        geom_path(color=pathcol) +
        coord_equal() +
        scale_fill_brewer(scalefill)
    return(p)
}

#generate a grid of points
xo<-seq(25,45,0.5)
yo<-seq(-15,5,0.5)
head(xy<-cbind(expand.grid(xo,yo)));names(xy)<-c("lon","lat")
head(xy.sp <- SpatialPoints(xy,proj4string=pj4s))
Overlay<-over(xy.sp,ctry)
xy<-xy[!apply(Overlay, 1, function(x) any(is.na(x))),]

#plot
(p<-fx.ggplot(ctry))

(P<-p+geom_point(data=xy, aes(x=lon, y=lat))) #addpoints returns Error

ggplot()+geom_point(data=xy, aes(x=lon, y=lat)) #This plots the points (as below) without error but in a new plot. 

#matrix
mat.ctry<-fx.polygon2raster2array(shp=ctry,xo,yo,cTim=1)
mat<-cbind(expand.grid(xo,yo),c(mat.ctry));names(mat)<-c(names(xy),"Z")
mat<-mat[!apply(mat, 1, function(x) any(is.na(x))),]
p+geom_raster(data=mat,aes(x=lon,y=lat,colour="red"))

#returns错误 然而ggplot()+geom_raster(data=mat,aes(x=lon,y=lat,colour="red"))返回预期的内容。

所以我在哪里失败？

Answer 1

如果其他人无法为他们获得接受的答案：@aosmith在对原始问题的评论中指出了一个关键。

添加geom_point(data=xy)会在图上创建一个新图层。 ggplot2期望这个新图层与原始图层的所有美学相匹配，因此您必须明确定义任何差异。在这种情况下，原始geom_polygon图层使用group和fill美学，但geom_point图层不使用group=NULL图层。因此，您必须为fill=NULL指定geom_point和(myplot + geom_point(data=xy, aes(group=NULL, fill=NULL))) ，如下所示：

{{1}}

Answer 2

让我们分解正在发生的事情并解决一些问题。首先，为代码/示例加载必要的库。

library("rgeos")
library("sp")
library("ggplot2")
library("plyr")

看看你的示例地图，我找出了你所拥有的东非国家。我从rworldmap包中提取了它们的形状文件。这些可能不如你的形状文件好，但它们现在会用。

library("rworldmap")
data(countriesLow)
ctry <- countriesLow[countriesLow$ISO3.1 %in% c("TZA", "KEN", "UGA", "RWA", "BDI"),]

创建您拥有的积分网格。我整理了一些代码，删除了对head的一些调用并简化了子集化代码。

#generate a grid of points
xy<-expand.grid(long=seq(25,45,0.5),lat=seq(-15,5,0.5))
xy.sp <- SpatialPoints(xy, proj4string=CRS(proj4string(ctry)))
Overlay<-over(xy.sp,ctry)
xy<-xy[!is.na(Overlay$ISO3.1),]

现在您的fx.ggplot来电可以重写为

fx.ggplot<-function(ctry, aesfill="id", scalefill="Country", pathcol="white") {
    ##ctry is a shapefile of countries
    ctry@data$id = rownames(ctry@data)
    ctry.points = fortify(ctry, region="id")
    ctry.df = join(ctry.points, ctry@data, by="id")
    ggplot(ctry.df, aes(long, lat)) +
        geom_polygon(aes_string(group="group", fill=aesfill)) +
        geom_path(colour = pathcol) +
        scale_fill_brewer(scalefill)
}

整体aes只是long和lat; geom_polygon需要额外的美学group和fill，并且使用aes_string进行设置，因为填充变量的名称正在传递给函数。

(p <- fx.ggplot(ctry))

这个版本中有一些工件但是（可能）做我正在使用的形状文件;我没有在你展示的情节中看到它们，所以你不应该有这个问题。

p + geom_point(data=xy)