如何调整树形图的y轴

时间:2013-09-30 07:19:43

标签: python scipy hierarchical-clustering dendrogram

我在制作层次聚类后使用scipy.cluster.hierarchy as sch绘制树状图。问题是聚类发生在树形图的顶部,在0.8和1.0之间,这是y轴的相似度。如何将所有图形从0切换到0.6,其中没有任何“有趣”的图形发生?

1 个答案:

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如果你真的只对之间的距离比例感兴趣,你可以

  • 调整输入链接(切断链接矩阵第三列中的偏移量)。这当然会拧紧绝对的共生距离。

  • 在对输入数据进行聚类之前对其进行一些规范化

或者你

  • 操纵树状图轴/适应极限(我没试过)