Question

使用RStudio - ＆gt; CompilePDF

在要使用pdflatex处理的.Rnw文档中，我想获得所有的列表 user（me）包通过文件中的library（）或require（）加载。我试过了使用sessionInfo（），如

   \AtEndDocument{
   \medskip
   \textbf{Packages used}: \Sexpr{names(sessionInfo()$loadedOnly)}.
   }

然而，这打印的只是knitr本身使用的包列表，

使用的包：digest，evaluate，formatR，highr，stringr，tools。

不是我明确提到的那些。我相信这是因为knitr经营着内部环境中的代码块，但我不知道如何访问它。

我知道使用cache = TRUE创建的文件缓存/ __包;在那儿没有缓存的任何方式自动生成？

Answer 1

没有缓存（cache = FALSE），你想要的基本上是

unique(c(.packages(), loadedNamespaces()))

启用缓存后，它会稍微复杂一些，因为包名也会被缓存;第二次编译文档时，除非您使缓存失效，否则不会加载这些包。在这种情况下，正如您所注意到的，有一个文件cache/__packages，您可以在那里读取包名称，所以

unique(c(.packages(), loadedNamespaces(), readLines('cache/__packages')))

您可能希望使代码更健壮（例如，先检查cache/__packages是否存在），并从列表中排除某些包（例如knitr及其朋友），如@ sebastian-c指出进行。

Answer 2

所以你想要的是除了基本包和knitr之外所有加载的包。如果我然后列出所有包并排除它们，你会得到你想要的：

p <- setdiff(.packages(), 
        c("knitr", "stats", "graphics", "grDevices", "utils", "datasets", 
          "methods", "base"))
p

如果您正在制作关于在knitr中制作内容的编辑文档，或者您想明确加载基础包，那么您必须做出一些例外。

Answer 3

这种方法的问题在于前导码中\ AtEndDocument {}块内的\ Sexpr {}在编织时间（.Rnw文件的开头，因此它返回一个空列表。在生成的.tex文件中，它显示为

\AtEndDocument{
\medskip
\textbf{Packages used}: .
}

这将起作用的唯一方法是包含代码以在.Rnw文件的末尾显式生成此文本（在我的例子中，这是一个儿童文件，例如，

...
\bibliography{graphics,statistics}

Inside child document:
\textbf{Packages used}: \Sexpr{setdiff(.packages(), 
        c("knitr", "stats", "graphics", "grDevices", "utils", "datasets", 
          "methods", "base"))}.

如何获取knitr .Rnw文档中使用的包列表？

3 个答案: