R中自定义函数的等高线图

Question

我正在使用一些自定义函数，我需要根据参数的多个值为它们绘制轮廓。

这是一个示例函数：

我需要绘制这样的轮廓图：

有什么想法吗？

感谢。

Answer 1

首先构造一个函数fourvar，将这四个参数作为参数。在这种情况下，您可以使用3个变量完成它，其中一个变量是lambda_1上的lambda_2。 Alpha1固定为2，因此alpha_1 / alpha_2将在0-10之间变化。

fourvar <- function(a1,a2,l1,l2){ 
  a1* integrate( function(x) {(1-x)^(a1-1)*(1-x^(l2/l1) )^a2} , 0 , 1)$value }

诀窍是要意识到integrate函数返回一个列表，你只想要该列表的'value'部分，因此它可以是Vectorize() - ed。

其次，您使用该函数构造矩阵：

  mat <- outer( seq(.01, 10, length=100),  
                seq(.01, 10, length=100), 
                Vectorize( function(x,y) fourvar(a1=2, x/2, l1=2, l2=y/2) ) )

然后，只能使用lattice::contourplot轻松完成在这些位置创建带标签的情节的任务。在进行了合理的搜索后，似乎geom_contour标记的解决方案仍然是ggplot2中正在进行的工作。我发现的唯一标签策略是外部包装。但是，在这种情况下，'directlabels'包的函数directlabel似乎没有足够的控制来正确地传播标签。在我看到的其他例子中，它确实在标绘区域周围散布标签。我想我可以查看代码，但由于它依赖于'proto'包，它可能会被奇怪地封装，所以我没看过。

require(reshape2)
mmat <- melt(mat)
str(mmat) # to see the names in the melted matrix
g <- ggplot(mmat, aes(x=Var1, y=Var2, z=value) )
g <- g+stat_contour(aes(col = ..level..), breaks=seq(.1, .9, .1) )
g <- g + scale_colour_continuous(low = "#000000", high = "#000000") # make black
install.packages("directlabels", repos="http://r-forge.r-project.org", type="source")
require(directlabels)
direct.label(g)

请注意，这些是矩阵的索引位置，而不是参数的比例，但这应该很容易修复。

另一方面，这是一个在格子中构建它的容易程度（我认为它看起来更“干净”：

  require(lattice)
  contourplot(mat, at=seq(.1,.9,.1))

Answer 2

我认为这个问题仍然很重要，metR包中的轮廓图标签已经有了一些发展。添加到前面的示例中，您还可以使用ggplot2

require(metR)
g + geom_text_contour(rotate = TRUE, nudge_x = 3, nudge_y = 5)