R中包含自定义字段类的引用类?

时间:2013-09-19 11:23:29

标签: r oop s4 reference-class

我想在另一个引用类中使用自定义引用类,但此代码失败:

nameClass <- setRefClass("nameClass", fields = list(first = "character",
                                                last = "character"),
                     methods = list(
                       initialize = function(char){
                         chunks <- strsplit(char,"\\.")
                         first <<- chunks[[1]][1]
                         last <<- chunks[[1]][2]
                       },
                       show = function(){
                         cat("Special Name Class \n:")
                         cat("First Name:")
                         methods::show(first)
                         cat("Last Name:")
                         methods::show(last)
                       }
                       ))
# this works fine
nameClass$new("tyler.durden")

当我尝试添加具有类nameClass字段的第二个类时,无法启动此类。

personClass <- setRefClass("personClass", fields = list(fullname = "nameClass",
                                                    occupation = "character"),
                       methods = list(
                         initialize = function(Obj){
                           nm  <- deparse(substitute(Obj))
                           fullname <<- nameClass$new(nm)
                           occupation <<- Obj
                         }))

这只会返回:

 Error in strsplit(char, "\\.") : 
 argument "char" is missing, with no default

我可以想象一个解决方案,其中nameClass是一个S4类但我读了一点让我有点害怕混合S4和引用类。我是否缺少某些东西,或者当我想要更准确地定义这个特定的名称字段而不仅仅是'字符'时,我应该简单地使用S4类吗?

我还发现this thread有一个很有希望的标题,但无法弄清楚这是如何解决我的问题的。

2 个答案:

答案 0 :(得分:10)

这是S4系统中常见问题的变体,其中继承以零参数调用new必须起作用。这是因为实现了继承的方式,其中实例化基类,然后使用派生类中的值填充。要实例化基类,需要在没有任何参数的情况下创建它。

说明了您遇到的问题
> nameClass()
Error in .Internal(strsplit(x, as.character(split), fixed, perl, useBytes)) : 
  'x' is missing

,解决方案是在初始化方法

中提供默认参数
initialize=function(char=charcter()) { <...> }

或以其他方式安排(例如,通过测试missing(char)正文中的initialize),以便对构造函数进行无参数调用。

可能编程最佳实践将指示initialize方法采用...参数并且在其主体中具有callSuper(),以便派生类可以利用基类(例如,字段分配)功能。为了避免无意中匹配未命名的参数的问题,我认为签名应该最终围绕一个看起来像

的模板构建
initialize(..., char=character()) { callSuper(...) }

此方案依赖于“空”nameClass的合适定义。以下可能有太多的意见和观点的变化,以立即有用,但......很容易将nameClass视为数据框中的“行”,但它更好(因为R在向量上效果最好) )将其视为描述列。考虑到这一点,“空”nameClass的合理表示是firstlast字段各自的长度为0.然后

nameClass <- setRefClass("nameClass",
    fields = list(first = "character", last = "character"),
    methods = list(
      initialize = function(..., char=character()){
          if (length(char)) {
              names <- strsplit(char, ".", fixed=TRUE)
              .first <- vapply(names, "[[", character(1), 1)
              .last <- vapply(names, "[[", character(1), 2)
          } else {
              .first <- character()
              .last <- character()
          }
          callSuper(..., first=.first, last=.last)
      }, show = function(){
          .helper <- function(x)
              sprintf("%s%s", paste(sQuote(head(x)), collapse=", "),
                      if (length(x) > 6) ", ..." else "")
          cat("Special Name Class (n = ", length(first), ")\n", sep="")
          cat("First names:", .helper(first), "\n")
          cat("Last names:", .helper(last), "\n")
      }))

包含

等测试用例
> nameClass()
Special Name Class (n = 0)
First names:  
Last names:  
> nameClass(char="Paul.Simon")
Special Name Class (n = 1)
First names: 'Paul' 
Last names: 'Simon' 
> nameClass(char=c("Paul.Simon", "Frank.Sinatra"))
Special Name Class (n = 2)
First names: 'Paul', 'Frank' 
Last names: 'Simon', 'Sinatra' 
> nameClass(char=paste(LETTERS, letters, sep="."))
Special Name Class (n = 26)
First names: 'A', 'B', 'C', 'D', 'E', 'F', ... 
Last names: 'a', 'b', 'c', 'd', 'e', 'f', ... 

派生类可能被定义为

personClass <- setRefClass("personClass",
    fields = list(fullname = "nameClass", occupation = "character"),
    methods = list(
      initialize = function(..., fullname=nameClass(),
                            occupation=character()) {
          callSuper(..., fullname=fullname, occupation=occupation)
      }))

包含

等测试用例
personClass()
personClass(fullname=nameClass())
personClass(fullname=nameClass(), occupation=character())
personClass(fullname=nameClass(char="some.one"), occupation="job")

答案 1 :(得分:1)

这似乎是因为你没有“nameClass”的默认构造函数:

nameClass$new()
Error in strsplit(char, "\\.") : 
  argument "char" is missing, with no default

如果你修改你的nameClass:

nameClass <- setRefClass("nameClass", fields = list(first = "character",
                                                    last = "character"),
                         methods = list(
                           initialize = function(s = NULL) {
                             if (!is.null(s) && nzchar(s)) {
                               chunks <- strsplit(s,"\\.")
                               first <<- chunks[[1]][1]
                               last <<- chunks[[1]][2]
                             }
                           },
                           show = function(){
                             cat("Special Name Class \n:")
                             cat("First Name:")
                             methods::show(first)
                             cat("Last Name:")
                             methods::show(last)
                           }
                         ))

然后:

nameClass$new()
Special Name Class 
:First Name:character(0)
Last Name:character(0)

你的personClass现在正在运行(但初始化方法很奇怪):

personClass$new("tyler.durden")
Reference class object of class "personClass"
Field "fullname":
Special Name Class 
:First Name:[1] "\"tyler"
Last Name:[1] "durden\""
Field "occupation":
[1] "tyler.durden"