R ggplot2 stat_density2d网格

时间:2013-09-17 15:32:14

标签: r ggplot2

在R,ggplot2中,如何将stat_density2d几何对象中使用的网格更改为受三角形区域约束?

我正在绘制不是标准ggplot2类型的三元图,轮廓在轴上溢出。实际三元图的代码非常冗长,但实质上,我需要将等高线约束为等边三角形。

以下是重现问题的示例代码:

library(ggplot2)

triangle <- data.frame(x=c(0,.5,1),y=c(0,1,0))
dummy <- data.frame(x=c(0.25,0.50,0.75),y=c(0.25,0.75,0.25))

p <- ggplot() + geom_polygon(data=triangle,aes(x,y),fill="transparent",color="black",size=1)
p <- p + geom_point(data=dummy,aes(x,y))
p <- p + stat_density2d(data=dummy,aes(x,y)) + theme_bw() +
  theme(panel.grid.major = element_blank(), panel.grid.minor = element_blank(), 
        panel.border = element_blank(), axis.ticks = element_blank(), 
        axis.text.x = element_blank(), axis.text.y = element_blank(),
        axis.title.x = element_blank(), axis.title.y = element_blank())
p

Sample

我认为这是由于网格与绘图区域的原始笛卡尔坐标边界相关联,为了演示,请考虑以下代码:

library(ggplot2)

triangle <- data.frame(x=c(0,.5,1),y=c(0,1,0))
dummy <- data.frame(x=c(0.25,0.50,0.75),y=c(0.25,0.75,0.25))

p <- ggplot() + geom_polygon(data=triangle,aes(x,y),fill="transparent",color="black",size=1)
p <- p + geom_point(data=dummy,aes(x,y))
p <- p + stat_density2d(data=dummy,aes(x,y),geom='tile',contour=F,fill="transparent",color="magenta") + theme_bw() +
  theme(panel.grid.major = element_blank(), panel.grid.minor = element_blank(), 
        panel.border = element_blank(), axis.ticks = element_blank(), 
        axis.text.x = element_blank(), axis.text.y = element_blank(),
        axis.title.x = element_blank(), axis.title.y = element_blank())
p

产生以下内容:

Sample2

那么如何将网格更改为受三角形约束。而不是原始的笛卡尔绘图界限?

2 个答案:

答案 0 :(得分:5)

自发布ggtern包以来,现在可以使用以下简单代码实现此结果:

#load the library
library(ggtern)

#Create dummy data
df <- data.frame(T=c(.8,.1,.1),
                 L=c(.1,.8,.1),
                 R=c(.1,.1,.8))

#Now plot the diagram
ggtern(data=df,aes(y=T,x=L,z=R)) + geom_point() + geom_density2d() + theme_bw()

enter image description here

答案 1 :(得分:1)

这将是一个有点粗糙的选择,只在这里部分证明:

d1 <- data.frame(x = c(0,0.5,0),y = c(0,1,1))
p + geom_polygon(data = d1,aes(x = x,y = y),fill = "white",colour = "black")

您可能会调查其他一些想法herehere,但我认为它们可能涉及丢弃ggplot2。

从理论上讲,你可以使用grid.path做一些奇特的事情,但那里的困难(一如既往)正在干净地在设备和情节坐标系之间移动。