创建数据框的线图

时间:2013-09-15 17:25:50

标签: r plot

所以我有一个问题,问我: 创建一个包含bigGene和smallGene的mRNA表达值的图,并将其保存为pdf文档(geneExpPlot.pdf)。     **注意:x轴上应该总共有6个点。应该有两行:一行用于bigGene,一行用于smallGene。您可能必须调整y限制以确保可以显示来自两个基因的所有点。

>expvalues
             Control1  Control2  Control3 Treatment1 Treatment2 Treatment3
  244901_at 229.98565 353.59949 178.49171  112.90800  152.91835  320.83235
  244902_at 171.14980  84.45094  41.37195  170.17262  134.40814  193.52611
  244903_at 314.97768 373.31250  52.90873  196.30256  237.51520  253.37774
  244904_at  24.04366 175.31604  94.68424   82.78488   18.43639   87.00857
  244905_at  15.86923  40.04125  58.76573  341.35340   16.80135   68.94204

我将bigGene和smallGene保存为:

bigGene <- names(which.max(averageExpValues)) #this is the row 24403_at
smallGene <- names(which.min(averageExpValues)) #this is the row 24404_at

其中averageExpValues<-c(apply(expvalues, 1, mean))

我是r的初学者,所以我不知道如何解决这个问题。 我确实尝试过做

plot(expvalues[c(bigGene,smallGene),])

但这给了我一个非常奇怪的图表......

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