所以我有一个问题,问我: 创建一个包含bigGene和smallGene的mRNA表达值的图,并将其保存为pdf文档(geneExpPlot.pdf)。 **注意:x轴上应该总共有6个点。应该有两行:一行用于bigGene,一行用于smallGene。您可能必须调整y限制以确保可以显示来自两个基因的所有点。
>expvalues
Control1 Control2 Control3 Treatment1 Treatment2 Treatment3
244901_at 229.98565 353.59949 178.49171 112.90800 152.91835 320.83235
244902_at 171.14980 84.45094 41.37195 170.17262 134.40814 193.52611
244903_at 314.97768 373.31250 52.90873 196.30256 237.51520 253.37774
244904_at 24.04366 175.31604 94.68424 82.78488 18.43639 87.00857
244905_at 15.86923 40.04125 58.76573 341.35340 16.80135 68.94204
我将bigGene和smallGene保存为:
bigGene <- names(which.max(averageExpValues)) #this is the row 24403_at
smallGene <- names(which.min(averageExpValues)) #this is the row 24404_at
其中averageExpValues<-c(apply(expvalues, 1, mean))
我是r的初学者,所以我不知道如何解决这个问题。 我确实尝试过做
plot(expvalues[c(bigGene,smallGene),])
但这给了我一个非常奇怪的图表......