在R中调用GPU函数

Question

我已成功安装 CUDA 和 rpud 。我能够编译并运行我的文件 vecAdd.cu ，但我想在R中调用此函数。我使用以下指令创建 vecAdd.o 和< strong> vecAdd.so ，我没有错误。

nvcc -m64 -I/usr/local/cuda-5.5/include -I/usr/include/R - I/usr/local/include -g -O2 -c -o VecAdd.o VecAdd.cu --ptxas-options -v -Xcompiler -fPIC

g++ -m64 -std=gnu99 -shared -L/usr/local/lib64 -o VecAdd.so VecAdd.o -L/usr/lib64/R/lib -lR -L/usr/local/cuda-5.5/lib64 -lcuda -lcudart -lcurand -lm

当我尝试使用以下方法将其加载到R中时

> dyn.load("/home/CUDACodes/VecAdd.so")

Error in dyn.load("/home/CUDACodes/VecAdd.so") : unable to load shared object '/home/CUDACodes/VecAdd.so': libcudart.so.5.5: cannot open shared object file: No such file or directory

不知道它是否相关，但当我尝试安装 gputools 包时出现此错误：

Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : unable to load shared object '/home/ac43/lib/R/gputools/libs/gputools.so': libcublas.so.5.5: cannot open shared object file: No such file or directory

Answer 1

将以下行添加到.csrc文件中修复它：setenv R_INC_PATH / usr / lib64 / R / include：$ LD_LIBRARY_PATH