tiff堆栈的阈值处理查看整个堆栈而不是单独的tiff图像

Question

我有一个tiff堆栈（黑白），当我在imageJ中打开堆栈中的单个图像时，对比度是完美的，但是，当我打开整个堆栈（移动的图像序列）时，对比度很糟糕对于最终的幻灯片（当然荧光已经漂白了）。在Matlab或imageJ中有一种方法可以确保对比度不是由整个堆栈决定的，而是由堆栈中的各个图像决定的（因此亮度的这种变化不再存在）。

让我知道如何更好地解释。这是一个非常简单的问题，但我不知道在没有看到的情况下理解是多么容易。

感谢

Answer 1

要校正荧光信号随时间的漂白，请考虑使用bleach corrector plugin进行ImageJ。 在ImageJ中对堆栈进行阈值处理时，您可以分别为每个切片计算阈值：

• 图片＆gt;调整＆gt;阈值... 的

• 取消选中堆栈直方图以预览基于当前切片计算的阈值
• 点击应用

• 在对话框中，选择计算每个图像的阈值，将所选的阈值方法分别应用于每个堆叠切片。

要获取此过程的宏源代码，请通过插件＆gt;启动ImageJ macro recorder。宏＆gt;在开始之前录制...... 。