关于R中聚类的简单事情

Question

根据我得到的结果（我在API中没有看到），hclust通过使用给定矩阵的每一行作为向量来工作。是否有任何方法可以使用它而不是使用列？

此外，dist是否工作相同或者是否与列一起工作？

Answer 1

您始终可以将hclust应用于转置矩阵：

# If you have observations matrix 
m <- matrix(1:100, nrow=20)
hc <- hclust(dist(t(m)))

  

此外，dist是否工作相同或者是否与列一起工作？

常规约定是列中的变量，行中的观察以及dist的工作方式：

dist                   package:stats                   R Documentation

Distance Matrix Computation

Description:
This function computes and returns the distance matrix computed by
using the specified distance measure to compute the distances
between the rows of a data matrix.

<强>更新

  

hclust的工作原理是将给定矩阵的每一行用作向量。

实际上hclust的内部实现应该无关紧要。你传递的是dist产生的相异结构作为参数，我几乎可以肯定，所有在dist中实现的度量产生了适当的对称距离矩阵。