Question

我曾经问了一个非常similar question并得到了一个从命令行起作用的响应，但现在我想使用R从Windows自动化这个过程（Linux更容易）。

这是我正在尝试做的事情：

创建本地目录（或已存在）
在云中生成一个与本地（based on this answer）同名的新github仓库
将.git添加到本地仓库
进行初步提交
建立云回购和本地回购之间的链接
将提交和本地存储库中的文件推送到github

我相信based on the output我在失败前一直到第5步（因为提交和本地目录中的文件永远不会转到云中的github）。我知道第2步有效，因为创建了空仓库here。我不知道如何测试第5步。在最后一步shell(cmd6, intern = T) RGui和RStudio导致永恒的死亡螺旋。问题是：如何将提交和本地存储推送到云端。

这是我的更新代码（用户特定的唯一内容是第三代码块中的用户名和密码）：

## Create Directory
repo <- "foo5"
dir.create(repo)
project.dir <- file.path(getwd(), repo) 

## Throw a READ.ME in the directory
cat("This is a test", file=file.path(project.dir, "READ.ME"))

## Github info (this will change per user)
password <-"pass" 
github.user <- "trinker"  

## Get git location
test <- c(file.exists("C:/Program Files (x86)/Git/bin/git.exe"),
    file.exists("C:/Program Files/Git/bin/git.exe"))
gitpath <- c("C:/Program Files (x86)/Git/bin/git.exe",
  "C:/Program Files/Git/bin/git.exe")[test][1]

## download curl and set up github api
wincurl <- "http://curl.askapache.com/download/curl-7.32.0-win64-ssl-sspi.zip"
url <- wincurl
tmp <- tempfile( fileext = ".zip" )
download.file(url,tmp)
unzip(tmp, exdir = tempdir())       
shell(paste0(tempdir(), "/curl http://curl.haxx.se/ca/cacert.pem -o " , 
    tempdir() , "/curl-ca-bundle.crt"))
json <- paste0(" { \"name\":\"" , repo , "\" } ") #string we desire formatting
json <- shQuote(json , type = "cmd" )
cmd1 <- paste0( tempdir() ,"/curl -i -u \"" , github.user , ":" , password , 
    "\" https://api.github.com/user/repos -d " , json )

shell(cmd1, intern = T)

## Change working directory
wd <- getwd()
setwd(project.dir)

## set up the .git directory
cmd2 <- paste0(shQuote(gitpath), " init")
shell(cmd2, intern = T)

## add all the contents of the directory for tracking
cmd3 <- paste0(shQuote(gitpath), " add .")  
shell(cmd3, intern = T)       

cmdStat <- paste0(shQuote(gitpath), " status")  
shell(cmdStat, intern = T)

## Set email (may not be needed)
Trim <- function (x) gsub("^\\s+|\\s+$", "", x) #remove trailing/leading white 

x <- file.path(path.expand("~"), ".gitconfig")
if (file.exists(x)) {
    y <- readLines(x)
    email <- Trim(unlist(strsplit(y[grepl("email = ", y)], "email ="))[2])
} else {
    z <- file.path(Sys.getenv("HOME"), ".gitconfig")
    if (file.exists(z)) {
        email <- Trim(unlist(strsplit(y[grepl("email = ", y)], "email ="))[2])
    } else {
        warning(paste("Set `email` in", x))
    }
}
cmdEM <- paste0(shQuote(gitpath), sprintf(" config --global user.email %s", email))        
system(cmdEM, intern = T)

## Initial commit
cmd4 <- paste0(shQuote(gitpath), ' commit -m "Initial commit"')  
system(cmd4, intern = T) 

## establish connection between local and remote
cmd5 <- paste0(shQuote(gitpath), " remote add origin https://github.com/",
    github.user, "/", repo, ".git")  
shell(cmd5, intern = T) 

## push local to remote 
cmd6 <- paste0(shQuote(gitpath), " push -u origin master")  
shell(cmd6, intern = T) 

setwd(wd)

我知道脚本有点长，但重新创建问题并复制问题是必要的：

注意我根据Simon的回答更新了问题，因为他是正确的，并且更接近推动。可以找到原始问题的内容here。

Answer 1

如果使用https地址，请确保：

定义了环境变量%HOME%
其中存在_netrc文件，其中包含正确的凭据以回送到您的仓库

该文件应包含：

machine github.com
login username
password xxxx
protocol https

即使您有activated the recent two-factor authentication on GitHub，也可以。

然后你的推动不会超时：

cmd6 <- paste0(shQuote(gitpath), " push -u origin master")  
shell(cmd6, intern = T)

这比setting public/private ssh keys更容易。

作为OP Tyler Rinker commented，我的其他答案“Git - How to use .netrc file on windows to save user and password”中说明了设置%HOME%。
这通常由git-cmd.bat完成：

if not exist "%HOME%" @set HOME=%HOMEDRIVE%%HOMEPATH%
@if not exist "%HOME%" @set HOME=%USERPROFILE%

但你也可以手动完成。

Answer 2

问题似乎只是混淆了ssh和https协议。

请注意，网址应为：

#  https:
"https://github.com/<username>/<myrepo>.git"

#  ssh:
"git@github.com:<username>/<repo>.git"

你有：

cmd5 <- paste0(shQuote(gitpath), " remote add origin https://github.com:",
github.user, "/", repo, ".git") 
cat( cmd5 )
"... remote add origin https://github.com:trinker/foo2.git"

只需将cmd5更改为

即可

# Note the forward slash at EOL in place of the colon
cmd5 <- paste0(shQuote(gitpath), " remote add origin https://github.com/",
github.user, "/", repo, ".git")
"... remote add origin https://github.com/trinker/foo2.git"

git add .之后立即运行它也不会有害：

cmdStat <- paste0(shQuote(gitpath), " status")  
shell(cmdStat, intern = T)

使用R将本地存储库推送到Windows上的github

2 个答案: