我有两个制表符分隔的文件,我需要针对另一个文件中的所有行测试第一个文件中的每一行。例如,
文件1:
row1 c1 36 345 A
row2 c3 36 9949 B
row3 c4 36 858 C
file2的:
row1 c1 3455 3800
row2 c3 6784 7843
row3 c3 10564 99302
row4 c5 1405 1563
假设我想输出(file1)中的所有行,其中file1的col [3]小于file2的任何(不是每个)col [2],因为col [1]是相同的。
预期产出:
row1 c1 36 345 A
row2 c3 36 9949 B
由于我在Ubuntu工作,我希望输入命令看起来像这样:
python code.py [file1] [file2] > [output]
我写了以下代码:
import sys
filename1 = sys.argv[1]
filename2 = sys.argv[2]
file1 = open(filename1, 'r')
file2 = open(filename2, 'r')
done = False
for x in file1.readlines():
col = x.strip().split()
for y in file2.readlines():
col2 = y.strip().split()
if col[1] == col2[1] and col[3] < col2[2]:
done = True
break
else: continue
print x
但是,输出如下所示:
row2 c3 36 9949 B
这对于较大的数据集很明显,但基本上我总是只得到嵌套循环中的条件为真的最后一行。我怀疑“休息”让我脱离了两个循环。我想知道(1)如何打破只有一个for循环,以及(2)如果这是我遇到的唯一问题。
答案 0 :(得分:23)
break
和continue
适用于最里面的循环。
问题是您只打开第二个文件一次,因此只读一次。当您第二次执行for y in file2.readlines():
时,file2.readlines()
将返回一个空的可迭代。
将file2 = open(filename2, 'r')
移至外圈,或使用seek()
快退至file2
的开头。
答案 1 :(得分:2)
您需要将数字字符串解析为相应的整数值。
您可以按如下方式使用int('hoge')
。
import sys
filename1 = sys.argv[1]
filename2 = sys.argv[2]
with open(filename1) as file1:
for x in file1:
with open(filename2) as file2:
col = x.strip().split()
for y in file2:
col2 = y.strip().split()
if col[1] == col2[1] and int(col[3]) < int(col2[2]):
print x