我正在努力将我编写的一些代码翻译成并行进程,以便在我家大学的计算机集群上进行分发。为了准备为集群编写脚本,我首先阅读了集群提供的Python代码示例片段之一:
#! /usr/bin/python
# This script replicates a given test with varied parameters
# creating unique submit scripts and executing the submission to the CRC SGE queue
# Imports
import os
import shutil
import string
basedir=os.getcwd()
origTestFol='wwd'
templFol='template'
origTestDir= basedir + '/' + origTestFol
templFolDir= basedir + '/' + templFol
steps=[0,1,2,3,4,5,6,7,8,9]
primes=[2,3,5,7,11,13,17,19,23,29,31]
trials=[6,7,8,9,10]
for step in steps:
newTestDir= origTestDir + '_nm_' + str(step)
if not os.path.exists(newTestDir):
os.mkdir(newTestDir)
os.chdir(newTestDir)
for trial in trials:
newTestSubDir= newTestDir + '/' + str(trial)
if not os.path.exists(newTestSubDir):
shutil.copytree(templFolDir,newTestSubDir)
os.chdir(newTestSubDir)
os.system('sed -i \'s/seedvalue/' + str(primes[trial]) + '/g\' wwd.nm.conf')
os.system('sed -i \'s/stepval/' + str(step) + '/g\' qsubScript.sh')
os.system('qsub qsubScript.sh')
os.chdir(basedir)
我可以按照最后四行的代码进行操作[例如直到“os.system('sed -i ...)”]然后很难跟随代码。是否有其他人可以帮助我理解最后四行正在做什么。有没有办法用伪代码来描述谎言?据我所知,第一个sed行尝试用primes [trial]的值替换“seedvalue”,但我不确定seedvalue是什么。我也不确定如何理解后续行中的“stepval”。任何其他人可以解决这些问题的亮点将是非常感谢。
答案 0 :(得分:1)
您可以在sed上进行一些搜索:http://en.wikipedia.org/wiki/Sed#In-place_editing
简而言之:sed -i 's/old/new/g' file
将所有old
的{{1}}替换为new
中的file
。 -i
标志告诉它在线执行,修改文件本身。
在您的代码中,seedvalue
和stepval
只是文本文件wwd.nm.conf
和qsubScript.sh
中的两个字。正如您在文本编辑器或文字处理器中所做的那样,这些命令正在替换这些单词。
答案 1 :(得分:1)
seedvalue
是一个字符串,因此其值本身与stepval
相同。
第一个sed
行将替换seedvalue
中的所有wwd.nm.conf
字符串(在所有行上,这是/g
所做的,它代表“全局”)价值str(primes[trial])
。想想这样:
在文件stepvalue
中找到文本wwd.nm.conf
的任何地方,放置值str(primes[trial])
(无论评估结果如何)。
第二次sed
调用会执行类似但stepval
和step
的结果,它将替换文件qsubScript.sh
中的文字。