从目录中的所有文件中查找生成单个输出的模式

Question

我正在尝试查找文件夹中所有* .txt文件中的模式，这些文件是行中数字列表。我想在包含* .vcf格式的一堆东西的文件中找到包含这些数字的行。不同的列表必须生成不同的输出文件，这些文件应该类似于file.output。 我试过这个但是没有用（抱歉，我很新手）也许我可以使用awk或其他更奇特的东西？

    for file in ./*.txt
    do
    cat $file|while read LINE
    do
    grep "$LINE" ./AC-AN-table.v2.vcf > "$file.output"
    done

Answer 1

我会这样做：

ls *.txt | perl -nle 'system("grep -f $_ ./AC-AN-table.v2.vcf > $_.output");

解释： perl -nle循环输入，并在每个循环中执行指定的perl表达式。更多信息请见perlrun，但简而言之：

  -n : loop over input without autoprinting
  -l : modify line endings
  -e : expression to execute

grep的-f选项提供一个文件，其中包含要搜索的模式列表。每行1个模式。