使用R中的xlsx包导入NA,<na>和空条目,无法删除NA值</na>

时间:2013-08-20 12:05:07

标签: r r-xlsx

我正在使用read.xlsx

从xlsx(https://www.dropbox.com/s/r5sn5pio5rnprdq/gesammelte%20Daten_1707.xlsx)文件导入数据
setwd("C:/***//Kultivierungen//1707_ADH//")
pH <- read.xlsx("gesammelte Daten_1707.xlsx", sheetName="pH")
OD <- read.xlsx("gesammelte Daten_1707.xlsx", sheetName="OD")
Glc <- read.xlsx("gesammelte Daten_1707.xlsx", sheetName="Glucose")
Ac <- read.xlsx("gesammelte Daten_1707.xlsx", sheetName="Acetate")

我想用

删除NA
OD <- OD[rowSums(is.na(OD))==0,]
Glc <- Glc[rowSums(is.na(Glc))==0,]
Ac <- Ac[rowSums(is.na(Ac))==0,]
pH <- pH[rowSums(is.na(pH))==0,]

..适用于ODpH数据,但不适用于AcGlc。删除NA值之前的结果如下所示:

  time.in.h               SPL1 SPL1_Error               SPL2 SPL2_Error               SPL3 SPL3_Error
1  0.000000               <NA>       <NA>               <NA>       <NA>               <NA>       <NA>
2  1.502222               <NA>       <NA>               <NA>       <NA>               <NA>       <NA>
3  3.687778 0.0602636534839925       0.06 0.0502197112366604       0.09 0.0301318267419962       0.03
4 10.248889                                                                                          
5 16.248333  0.118460019743337       0.06 0.0829220138203356       0.12  0.106614017769003       0.18
6 21.653056 0.0644511581067472       0.03 0.0161127895266868       0.15 0.0483383685800604       0.12
7 29.653333                                                                                          
8 37.652778                                                                                          
9 43.391667  0.342347696879643       0.18  0.271025260029718       0.18  0.727488855869242       0.24

删除NA值..:

  time.in.h               SPL1 SPL1_Error               SPL2 SPL2_Error               SPL3 SPL3_Error
3  3.687778 0.0602636534839925       0.06 0.0502197112366604       0.09 0.0301318267419962       0.03
4 10.248889                                                                                          
5 16.248333  0.118460019743337       0.06 0.0829220138203356       0.12  0.106614017769003       0.18
6 21.653056 0.0644511581067472       0.03 0.0161127895266868       0.15 0.0483383685800604       0.12
7 29.653333                                                                                          
8 37.652778                                                                                          
9 43.391667  0.342347696879643       0.18  0.271025260029718       0.18  0.727488855869242       0.24

str()返回以下内容:

> str(Glc)
'data.frame':   9 obs. of  17 variables:
 $ time.in.h : num  0 1.5 3.69 10.25 16.25 ...
 $ SPL1      : Factor w/ 5 levels "","0.0602636534839925",..: NA NA 2 1 4 3 1 1 5
 $ SPL1_Error: Factor w/ 4 levels "","0.03","0.06",..: NA NA 3 1 3 2 1 1 4
 $ SPL2      : Factor w/ 5 levels "","0.0161127895266868",..: NA NA 3 1 4 2 1 1 5
 $ SPL2_Error: Factor w/ 5 levels "","0.09","0.12",..: NA NA 2 1 3 4 1 1 5

之前使用一组不同的data / xlsx文件工作得很好,我试图排除xlsx文件中的所有格式问题,但是找不到任何东西....之前有人有这个吗?< / p>

3 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我不完全确定你的问题是什么,但这里有一些修正:

您想用零替换NA值吗?在这种情况下,您可以尝试:

Glc[is.na(Glc)] <- 0

或者您想删除NAs的观察结果?在这种情况下,它似乎正好适用于前两个观察。但是例如第四个观察似乎在xlsx文件中还有其他东西(零?)而不是NA。

答案 1 :(得分:0)

似乎葡萄糖和醋酸纤维素片中的空细胞被识别为文本,虽然我不确定为什么(Excel不是我真正的专长......)。

当我将xlsx文件中的列中的空单元格替换为0然后我再次删除这些0时read.xlsx会将其作为numeric向量而不是factor导入将NA分配给空单元格。然后,您可以使用data <- data[rowSums(is.na(data))==0,]删除包含NA的行。

无法告诉你这里到底发生了什么,但上述解决方案似乎有效。

答案 2 :(得分:0)

我遇到了同样的问题并解决了。在Excel中,而不是删除,请使用“全部清除”,然后保存您的Excel文件并将其导入R。这样R不会显示任何N / A。