在Pig中提取CSV文件的第一行

时间:2013-08-18 03:25:41

标签: csv apache-pig latin

我有几个CSV文件,标题始终是文件中的第一行。什么是将这个行作为Pig中的字符串从CSV文件中删除的最佳方法?使用sed,awk等进行预处理不是一种选择。

我尝试使用常规PigStorage和Piggy bank CsvLoader加载文件,但我不清楚如何获得第一行,如果有的话。

我愿意写一个UDF,如果这就是它。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

免责声明:我对Java不太满意。

您将需要一个UDF。我不确定你要求的是什么,但是这个UDF将采用一系列CSV文件并将它们转换成地图,其中键是文件顶部的值。这应该是足够的骨架,以便您可以将其更改为您想要的。

我远程和本地完成的几项测试表明这将有效。

package myudfs;
import java.io.IOException;
import org.apache.pig.LoadFunc;

import java.util.Map;
import java.util.HashMap;
import java.util.ArrayList;
import org.apache.pig.data.Tuple;
import org.apache.pig.data.TupleFactory;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Job;
import org.apache.hadoop.mapreduce.InputFormat;
import org.apache.hadoop.mapreduce.RecordReader;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.TextInputFormat;

import org.apache.pig.PigException;
import org.apache.pig.backend.executionengine.ExecException;
import org.apache.pig.backend.hadoop.executionengine.mapReduceLayer.PigSplit;

public class ExampleCSVLoader extends LoadFunc {
    protected RecordReader in = null;
    private String fieldDel = "" + '\t';
    private Map<String, String> outputMap = null;
    private TupleFactory mTupleFactory = TupleFactory.getInstance();

    // This stores the fields that are defined in the first line of the file
    private ArrayList<Object> topfields = null;

    public ExampleCSVLoader() {}

    public ExampleCSVLoader(String delimiter) {
        this();
        this.fieldDel = delimiter;
    }

    @Override
    public Tuple getNext() throws IOException {
        try {
            boolean notDone = in.nextKeyValue();
            if (!notDone) {
                outputMap = null;
                topfields = null;
                return null;
            }

            String value = in.getCurrentValue().toString();
            String[] values = value.split(fieldDel);
            Tuple t =  mTupleFactory.newTuple(1);

            ArrayList<Object> tf = new ArrayList<Object>();

            int pos = 0;
            for (int i = 0; i < values.length; i++) {
                if (topfields == null) {
                    tf.add(values[i]);
                } else {
                    readField(values[i], pos);
                    pos = pos + 1;
                }
            }
            if (topfields == null) {
                topfields = tf;
                t = mTupleFactory.newTuple();
            } else {
                t.set(0, outputMap);
            }

            outputMap = null;
            return t;
        } catch (InterruptedException e) {
            int errCode = 6018;
            String errMsg = "Error while reading input";
            throw new ExecException(errMsg, errCode,
                    PigException.REMOTE_ENVIRONMENT, e);
        }

    }

    // Applies foo to the appropriate value in topfields
    private void readField(String foo, int pos) {
        if (outputMap == null) {
            outputMap = new HashMap<String, String>();
        }
        outputMap.put((String) topfields.get(pos), foo);
    }

    @Override
    public InputFormat getInputFormat() {
        return new TextInputFormat();
    }

    @Override
    public void prepareToRead(RecordReader reader, PigSplit split) {
        in = reader;
    }

    @Override
    public void setLocation(String location, Job job)
            throws IOException {
        FileInputFormat.setInputPaths(job, location);
    }
}

示例输出加载目录:

csv1.in             csv2.in
-------            ---------
A|B|C               D|E|F
Hello|This|is       PLEASE|WORK|FOO
FOO|BAR|BING        OR|EVERYTHING|WILL
BANG|BOSH           BE|FOR|NAUGHT

生成此输出:

A: {M: map[]}
()
([D#PLEASE,E#WORK,F#FOO])
([D#OR,E#EVERYTHING,F#WILL])
([D#BE,E#FOR,F#NAUGHT])
()
([A#Hello,B#This,C#is])
([A#FOO,B#BAR,C#BING])
([A#BANG,B#BOSH])

()是文件的顶行。 getNext()要求我们返回一些内容,否则文件将停止处理。因此,它们返回一个空模式。

答案 1 :(得分:2)

如果您的CSV符合Excel 2007的CSV惯例,您可以使用Piggybank中已有的加载程序http://svn.apache.org/viewvc/pig/trunk/contrib/piggybank/java/src/main/java/org/apache/pig/piggybank/storage/CSVExcelStorage.java?view=markup

可以跳过CSV标题SKIP_INPUT_HEADER