R中的并行计算(Windows):将代码从foreach%do%更改为foreach%dopar%

时间:2013-08-15 16:23:33

标签: r parallel-processing regression multivariate-testing

我编写了一个代码来运行多个证券的多个时间序列滚动回归。由于证券数量超过10,000,并且每个安全性的滚动窗口超过200个,因此顺序设置的运行时间(使用foreach%do%)大约为30分钟。

我想使用“doParrallel”后端来实现foreach%dopar%用于并行计算。只需在代码中使用%dopar%更改%do%即可。我对这种并行计算方法很陌生,希望得到一些帮助。

这是foreach%do%code:

sec = ncol(ret.zoo)
num.factors = 2
rows = nrow(ret.zoo) - 60 + 1
beta.temp = matrix(nc = num.factors + 1, nr = sec*rows)
gvkey.vec = matrix(nc = 1, nr = sec*rows)

d = 1
foreach(i=1:sec) %do% {
      df = merge(ret.zoo[,i], data)
      names(df) <- c("return", names(data))
      gvkey = substr(colnames(ret.zoo)[i],2,9)

      reg = function(z) {
          z.df = as.data.frame(z)
          ret = z.df[,which(names(z.df) ==  "return")]
          ret.no.na = ret[!is.na(ret)]
          if(length(ret.no.na) >= 30) {
             coef(lm(return ~ VAL + SIZE, data = as.data.frame(z), na.action = na.omit))
          }
          else {
             as.numeric(rep(NA,num.factors + 1))   ## the "+1" is for the intercept value
          }     
     }

     beta = rollapply(df, width = 60, FUN = reg, by.column = FALSE, align = "right")
     beta.temp[d:(d+rows-1),] = beta
     gvkey.vec[d:(d+rows-1),] = gvkey
     d = d+rows
}
beta.df = data.frame(secId = gvkey.vec, date = rep(index(beta), sec), beta.temp)
colnames(beta.df) <- c("gvkey", "date", "intercept", "VAL", "SIZE")

为了使用%dopar%启用并行计算,我调用并注册了后端“doParallel”。

非常感谢!

更新

这是我的第一次尝试:

library(doParallel) ## parallel backend for the foreach function
registerDoParallel()

sec = ncol(ret.zoo)
num.factors = 2
rows = nrow(ret.zoo) - 60 + 1

result <- foreach(i=1:sec) %dopar% {
    library(zoo)
    library(stats)

    df = merge(ret.zoo[,i], data)
    names(df) <- c("return", names(data))
    gvkey = substr(colnames(ret.zoo)[i],2,9)

    reg = function(z) {
        z.df = as.data.frame(z)
        ret = z.df[,which(names(z.df) ==  "return")]
        ret.no.na = ret[!is.na(ret)]
        if(length(ret.no.na) >= 30) {
            coef(lm(return ~ VAL + SIZE, data = as.data.frame(z), na.action = na.omit))
        }
        else {
            as.numeric(rep(NA,num.factors + 1))   ## the "+1" is for the intercept value
        }   
    }

    rollapply(df, width = 60, FUN = reg, by.column = FALSE, align = "right")
}
beta.df = do.call('combine', result)

这完美地工作直到循环结束。但是,beta.df = do.call('combine', result)会出现以下错误:Error in do.call("combine", result) : could not find function "combine"

如何组合结果的输出。现在它是一个列表而不是数据帧。

谢谢,

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

以下是将不同群集的结果合并到数据帧中的方法(从运行时的角度来看非常有效):

lstData <- Map(as.data.frame, result)
dfData <- rbindlist(lstData)
beta.df = as.data.frame(dfData)