我正在尝试匹配perl中第一次和第二次出现的字符串。前几行输入(包含在@intersect中)是:
'gi|112807938|emb|CU075707.1|_Xenopus_tropicalis_finished_cDNA,_clone_TNeu129d01 C1:TCONS_00039972(XLOC_025068),_12.9045:32.0354,_Change:1.3118,_p:0.00025,_q:0.50752 C2:TCONS_00045925(XLOC_029835),_10.3694:43.8379,_Change:2.07985,_p:0.0004,_q:0.333824',
'gi|115528274|gb|BC124894.1|_Xenopus_laevis_islet-1,_mRNA_(cDNA_clone_MGC:154537_IMAGE:8320777),_complete_cds C1:TCONS_00080221(XLOC_049570),_17.9027:40.8136,_Change:1.18887,_p:0.00535,_q:0.998852 C2:TCONS_00092192(XLOC_059015),_17.8995:35.5534,_Change:0.990066,_p:0.0355,_q:0.998513',
'gi|118404233|ref|NM_001078963.1|_Xenopus_(Silurana)_tropicalis_pancreatic_lipase-related_protein_2_(pnliprp2),_mRNA C1:TCONS_00031955(XLOC_019851),_0.944706:5.88717,_Change:2.63964,_p:0.01915,_q:0.998852 C2:TCONS_00036655(XLOC_023660),_2.31819:11.556,_Change:2.31757,_p:0.0358,_q:0.998513',
我想要提取的信息是C1和C2的'更改:[值]'(由选项卡分隔),使用以下内容:
#!/usr/bin/perl -w
use strict;
use File::Slurp;
use Data::Dumper;
$Data::Dumper::Sortkeys = 1;
my @log_change;
foreach (@intersect) {
chomp;
my @condition1_match = ($_ =~ /(C1:).*Change:(-?\d+\.\d+)/g);
my @condition2_match = ($_ =~ /(C2:).*Change:(-?\d+\.\d+)/g);
push @log_change, "@condition1_match\t@condition2_match";
}
print Dumper (\@log_change);
打印:
'C1: 2.07985 C2: 2.07985',
'C1: 0.990066 C2: 0.990066',
'C1: 2.31757 C2: 2.31757',
即。 C1和C2的值相同。很明显,我的循环在@condition1_match
和@condition2_match
中存储了C2的值。
我的问题是:如何指定我希望第一次迭代'更改:[值]'推送到@condition1_match
而第二次推送到@condition2_match
?
答案 0 :(得分:4)
正在发生的事情是,你的正则表达式尽可能匹配.*
。您需要做的是使量词变得懒惰(非贪婪),这可以通过添加问号?
来完成。
my @condition1_match = ($_ =~ /(C1:).*?Change:(-?\d+\.\d+)/g);
# ^
my @condition2_match = ($_ =~ /(C2:).*?Change:(-?\d+\.\d+)/g);
# ^
这样,正则表达式将匹配尽可能少的字符,直到它“看到”Change:(-?\d+\.\d+)/g)
。
您可以在某些在线正则表达式网站上查看您完全匹配的内容,例如this site。