在命令提示符下使用imagej打开raw

时间:2013-08-09 20:39:40

标签: image image-processing batch-file cmd imagej

我正在尝试创建一个.bat文件来读取.bsv文件并将它们转换为颜色png。第一部分是使用imagej打开.bsv,然后使用我添加的“全部保存”插件。我尝试制作一个宏但它只是给我错误。在命令提示符下,我将如何使用图像j执行:

文件>导入 - > RAW-> myfile.bsv 并选择8位,宽度:4000,高度:2672,偏移到第一个图像:0,图像数量:40,图像之间的间隙:0,小端字节顺序。

然后

plugins->全部保存

感谢您提供的任何帮助!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

在ImageJ中使用macro recorder插件>宏>记录... ),您描述的过程会生成以下代码:

run("Raw...", "open=/path/to/myfile.bsv image=8-bit width=4000 height=2672 offset=0 number=40 gap=0 little-endian");
run("Save All");

如果您保存此宏文件,例如作为 mymacro.ijm ,您应该可以使用像这样的宏选项运行ImageJ(取决于您的平台):

-macro mymacro.ijm

希望有所帮助。