我有这样的意见:
rs10000004 C T 4 rs10000004 0 75625312 C C C C T 0 C T
rs10000005 G A 4 rs10000005 0 75625355 G 0 A A A G A A
如果列中的值与第2个字段$ 2相同,或者如果该值与第3个字段$ 3相同,则我想将8个列替换为“A”。否则,该值按原样打印(某些列中预期为零值)
预期输出
rs10000004 C T 4 rs10000004 0 75625312 A A A A B 0 A B
rs10000005 G A 4 rs10000005 0 75625355 A 0 B B B A B B
我尝试了以下但是它没有给我任何结果只是空行。改进我的代码对我来说比向aw +
以外的东西展示一个新的解决方案更好cat input | awk '{ for(i=8; i<=NF; i++) { if($i == $2) $i="A"; else if($i == $3) $i="B"; else $i == 0; } print $i }'
提前致谢
答案 0 :(得分:2)
代码:
awk '
{
for (i=8; i<=NF; i++) {
if ($i == $2) {
$i = "A";
}
else {
if ($i == $3) {
$i = "B";
}
else {
$i = 0;
}
}
}
print;
}' input
或更短:
awk '
{
for (i=8; i<=NF; i++) {
if ($i == $2)
$i="A";
else
if ($i == $3)
$i="B";
else
$i = 0;
}
}
1' input
输出:
rs10000004 C T 4 rs10000004 0 75625312 A A A A B 0 A B
rs10000005 G A 4 rs10000005 0 75625355 A 0 B B B A B B