Question

我正在尝试使用外部硬盘中的目录作为工作目录使用R.我可以将工作目录设置为我想要的位置，但是当我使用list.files时，R看不到任何内容。我也无法使用read.delim加载文件。

例如：

> rm(list = ls())
> WD<-"../../../Volumes/My_HD/my_working_directory" 
> setwd(WD) 
> getwd()
[1] "/Volumes/My_HD/my_working_directory"

到目前为止一直很好，但随后：

> list.files(WD)
character(0)

虽然我希望我知道的文件列表在那里，我可以通过Finder和终端查看和打开。实际上R脚本本身就在该目录中。

如果那时我尝试打开一个文件，我得到这样的东西：

> myfile <- read.delim(paste(WD,"/file_name", sep = ""), header = T)
Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, "rt") :
cannot open file '../../../Volumes/My_HD/my_working_directory/file_name': No such file or directory

我认为我在指定目录的路径时做错了，但我尝试从RStudio点击（会话＆gt;设置工作目录和＆gt;到源文件位置或＆gt;选择目录...）并得到了同样不愉快的结果。

我在MacBookPro（OS X 10.7.05）上使用R版本2.15.1。我正在从RStudio版本0.97.551运行R，但问题与RStudio无关，因为当我直接尝试R时也会发生。

非常感谢任何帮助。感谢。

Answer 1

由于我认为你想在你的路径中保持一些相对性，并且因为你正在使用RStudio，我将分享我经常使用的一种策略。如果我正确地确定了你正在寻找的东西，那么这应该完全回避这个问题。

首先在RStudio中创建一个新项目。打开该项目后，您会发现工作目录getwd()将方便地设置在项目文件所在的位置。

如果您正在做更大的事情，可以使用“ProjectTemplate”软件包让自己站稳脚跟。在我的系统上：

# install.packages(c("ProjectTemplate"))
library(ProjectTemplate)
create.project("~/Desktop/MyProject")

这将设置一个项目框架，包括单元测试文件夹，doc文件夹以及“正确”R项目可能需要的所有其他内容。

接下来，我如上所述从RStudio创建一个项目。从现有目录创建它。项目将打开，您的所有路径都将相对于“MyProject”文件夹的根目录。

我也喜欢在我使用它时初始化一个git存储库。从OS X终端窗口：

$ cd ~/Desktop/MyProject; git init

...然后添加/提交裸骨架

$ git add * ; git commit -m "initial project skeleton"

从您的RStudio会话中，您可以加载相对于项目根目录的内容。假设您的数据子文件夹中有iris.csv：

read.csv("./data/iris.csv", header=TRUE)

R list.files（my_working_directory）显示没有文件，但我知道它们在那里。怎么修？

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