RDotNet与R脚本

时间:2013-08-05 10:22:25

标签: c# r scripting r.net

当使用RDotNet进行统计计算而不是生成R脚本文本文件并使用例如使用例如从应用程序运行它时,优势/劣势是什么?的Process.Start?或者还有其他更好的方法吗?

我需要执行大量命令,并且感觉将它们逐个发送到R需要花费很多时间。

3 个答案:

答案 0 :(得分:5)

我会说以下两个场景是陈规定型的:

  1. .NET代码和R代码是完全分开的,R代码和.NET代码之间不需要很多交互。例如,.NET代码收集一些信息,并在其上启动处理脚本,然后.NET代码获取结果。在这种情况下,生成一个R进程(Process.Start)是一种简单的方法来实现它。
  2. .NET代码和R代码之间需要进行大量的交互,工作流程包括经常在.NET和R之间来回切换。在这种情况下,更重量级,灵活的解决方案,如RDotNet非常有意义。 RDotNet允许更容易地集成.NET代码和R代码,其代价是通常难以学习,更难调试,并且通常需要针对新版本的R等进行更新。

答案 1 :(得分:2)

使用Process.Start,您将启动一个新的R会话。这可能需要一些时间,特别是如果您在脚本中使用需要加载的不同包。

如果您使用R.NET,您可以创建一个R实例,并继续与它交谈。因此,如果您已经创建了一个Web服务来连接R和ASP,那么您不希望一直启动R,因为这将非常耗费时间。您只需要一次,就可以以交互方式使用它。

答案 2 :(得分:2)

R.NET目前可以启动一次。并行执行会有问题。

建议使用RScript。

我们的解决方案基于stackoverflow上的这个答案Call R (programming language) from .net

随着monor更改,我们从字符串发送R代码并将其保存到临时文件,因为用户在需要时运行自定义R代码。

public static void RunFromCmd(string batch, params string[] args)
{
    // Not required. But our R scripts use allmost all CPU resources if run multiple instances
    lock (typeof(REngineRunner))
    {
        string file = string.Empty;
        string result = string.Empty;
        try
        {
            // Save R code to temp file
            file = TempFileHelper.CreateTmpFile();
            using (var streamWriter = new StreamWriter(new FileStream(file, FileMode.Open, FileAccess.Write)))
            {
                streamWriter.Write(batch);
            }

            // Get path to R
            var rCore = Registry.LocalMachine.OpenSubKey(@"SOFTWARE\R-core") ??
                        Registry.CurrentUser.OpenSubKey(@"SOFTWARE\R-core");
            var is64Bit = Environment.Is64BitProcess;
            if (rCore != null)
            {
                var r = rCore.OpenSubKey(is64Bit ? "R64" : "R");
                var installPath = (string)r.GetValue("InstallPath");
                var binPath = Path.Combine(installPath, "bin");
                binPath = Path.Combine(binPath, is64Bit ? "x64" : "i386");
                binPath = Path.Combine(binPath, "Rscript");
                string strCmdLine = @"/c """ + binPath + @""" " + file;
                if (args.Any())
                {
                    strCmdLine += " " + string.Join(" ", args);
                }
                var info = new ProcessStartInfo("cmd", strCmdLine);
                info.RedirectStandardInput = false;
                info.RedirectStandardOutput = true;
                info.UseShellExecute = false;
                info.CreateNoWindow = true;
                using (var proc = new Process())
                {
                    proc.StartInfo = info;
                    proc.Start();
                    result = proc.StandardOutput.ReadToEnd();
                }
            }
            else
            {
                result += "R-Core not found in registry";
            }
            Console.WriteLine(result);
        }
        catch (Exception ex)
        {
            throw new Exception("R failed to compute. Output: " + result, ex);
        }
        finally
        {
            if (!string.IsNullOrWhiteSpace(file))
            {
                TempFileHelper.DeleteTmpFile(file, false);
            }
        }
    }
}

完整博文:http://kostylizm.blogspot.ru/2014/05/run-r-code-from-c-sharp.html