Question

我大致有这个功能：

plot_pca_models <- function(models, id) {
  library(lattice)

  splom(models, groups=id)
}

我称之为：

plot_pca_models(data.pca, log$id)

导致此错误：

Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'id' not found

当我在没有包装功能的情况下调用它时：

splom(data.pca, groups=log$id)

它引发了这个错误：

Error in log$id : object of type 'special' is not subsettable

但是当我这样做时：

 id <- log$id
 splom(models, groups=id)

它的行为符合预期。

任何人都可以解释为什么它的行为如此以及如何纠正它？感谢。

顺便说一句：我在这里也知道类似的问题，例如：

但他们都没有帮助我。

修改：根据要求，有完整的“plot_pca_models”功能：

plot_pca_models <- function(data, id, sel=c(1:4), comp=1) {
  # 'data' ... princomp objects
  # 'id'   ... list of samples id (classes)
  # 'sel'  ... list of models to compare
  # 'comp' ... which pca component to compare

  library(lattice)

  models <- c()
  models.size <- 1:length(data)
  for(model in models.size) {
    models <- c(models, list(data[[model]]$scores[,comp]))
  }
  names(models) <- 1:length(data)

  models <- do.call(cbind, models[sel])

  splom(models, groups=id)
}

EDIT2 ：我设法使问题重现。

require(lattice)
my.data <- data.frame(pca1 = rnorm(100), pca2 = rnorm(100), pca3 = rnorm(100))
my.id <- data.frame(id = sample(letters[1:4], 100, replace = TRUE))

plot_pca_models2 <- function(x, ajdi) {
  splom(x, group = ajdi)
}

plot_pca_models2(x = my.data, ajdi = my.id$id)

产生与上述相同的错误。

Answer 1

log是基础R中的一个函数。良好的做法是不在函数之后命名对象......它可能会造成混淆。在一个干净的R会话中键入log$test，您将看到发生了什么：

object of type 'special' is not subsettable

Answer 2

问题是splom以非标准方式评估其groups参数。快速解决方法是重写函数，以便使用适当的语法构造调用：

f <- function(data, id)
eval(substitute(splom(data, groups=.id), list(.id=id)))

# test it
ir <- iris[-5]
sp <- iris[, 5]
f(ir, sp)

Answer 3

以下是洪爱答案的修改。首先，我建议在主数据框中包含id，即

my.data <- data.frame(pca1 = rnorm(100), pca2 = rnorm(100), pca3 = rnorm(100), id = sample(letters[1:4], 100, replace = TRUE))

..然后

plot_pca_models2 <- function(x, ajdi) {
    Call <- bquote(splom(x, group = x[[.(ajdi)]]))    
    eval(Call)
    }
plot_pca_models2(x = my.data, ajdi = "id")

混淆的原因是格子::: splom.formula中的以下行：

groups <- eval(substitute(groups), data, environment(formula))

......唯一的一点就是能够指定没有引号的组，即

# instead of
splom(DATA, groups="ID")
# you can now be much shorter, thanks to eval and substitute:
splom(DATA, groups=ID)

但是，当然，这使得使用splom（和其他函数，例如使用“非标准评估”的替代品）更难以在其他函数中使用，并且违背了在R的其余部分“大部分”遵循的哲学。 / p>

我不明白函数里面的错误“找不到对象”

3 个答案: