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Question

我的文件在一个目录中，格式为

- 0163-301_02_29_2008_off.nii
- 0163-301_02_29_2008_on.nii
- 0164-303_11_30_2007_off.nii
- 0164-303_11_30_2007_on.nii

我想运行一个涉及文件名称作为输入的命令。地址路径是

/Users/jjuan/Documents/MTAutism/new_MTR_datasets/UsableNii/0163-301_02_29_2008_off.nii

等等。

到目前为止，我这是我编写的代码

for file in *_on.nii; do

set fileroot = ${file} cut -b 1-78
echo $fileroot

/usr/local/fsl414/bin/flirt -in $file  -ref /Users/jjuan/Documents/MTAutism/new_MTR_datasets/UsableNii/$fileroot_off.nii -out /Users/jjuan/Documents/MTAutism/new_MTR_datasets/UsableNii/$fileroot_ontooff -omat /Users/jjuan/Documents/MTAutism/new_MTR_datasets/UsableNii/$fileroot_ontooff.mat -bins 256 -cost corratio -searchrx -90 90 -searchry -90 90 -searchrz -90 90 -dof 6  -interp trilinear

done

但是，$ fileroot集不会出现在指定的路径中，并且只输出一个空格。

Answer 1

修复你的变量命名，对于初学者来说：

for files in *_on.nii; do
    ^^^^^- files with an S

set fileroot = ${file} cut -b 1-78
                 ^^^^-- -file WITHOUT an S

Answer 2

不要使用set，因为它的目的是操纵shell选项/变量，而不是使用它：

fileroot="$(echo ${file} | cut -b 1-78)"

还要确保将大括号中fileroot变量的引用括起来，即${fileroot}_ontooff以分隔变量名称

Answer 3

我并不完全按照您的意愿行事，但如果您想从0163-301_02_29_2008_on.nii更改为0163-301_02_29_2008_off.nii：

cd /Users/jjuan/Documents/MTAutism/new_MTR_datasets/UsableNii
for on_file in *_on.nii; do
    off_file=$PWD/${on_file/on.nii/off.nii}
    # Do something with off_file
done

以上用“off.nii”替换“on.nii”

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我更改了代码以包含每个请求的完整路径。

如何将文件名称指定为输入目录的一部分？

3 个答案:

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