使用awk打印三列，然后打印三列

Question

我想从一个更大的文件创建一些文件，除以列。例如，我的较大文件的标题如下所示：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C SNP2A SNP2B SNP2C SNP3A SNP3B SNP3C

我想创建这些文件：

Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C

Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C

Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C

我一直在尝试使用awk，但我对它有点新手，所以我的命令目前是：

for ((i=1; i<=440;i++)); do awk -f printindivs.awk inputfile done

其中printindivs.awk是： {print $1 $2 $3 $((3*$i)+1) $((3*$i)+2) $((3*$i)+3))}

我得到的输出表明我尝试获得三组的方式是错误的：我该怎么做？

由于

Answer 1

您可以轻松地执行此操作只需一个简单的awk脚本：

$ awk '{for(i=4;i<=NF;i+=3)print $1,$2,$3,$i,$(i+1),$(i+2) > ("out"++j)}' file

输出文件位于out[1..n]：

$ cat out1
Name Chr Position SNP1A SNP1B SNP1C

$ cat out2
Name Chr Position SNP2A SNP2B SNP2C

$ cat out3
Name Chr Position SNP3A SNP3B SNP3C