我使用以下内容拟合模型:
mymodel <- glm(LS ~ bs(LA, df = 8) + bs(IN, df = 7),
family = binomial, data = mydata, na.action = na.omit)
没问题,我现在的模型适合我正在尝试提取使用的结点。我点了一篇关于使用attr
和str
提取结点的帖子。那是一个只是样条的模型。我认为结点在结构中的某个地方
我致电str(mymodel$terms)
有..-attr(*, "variables")
。我无法进一步attr
,但我相对肯定这基本上是我需要做的。任何获得结的指导都表示赞赏。
答案 0 :(得分:3)
您可以使用
eval(attr(mymodel$terms, "predvars"))
用于评估拟合模型的predvars
组件的terms
属性中包含的语言对象。
这是一个傻装模型的例子
mod <- glm(rnorm(length(women$height)) ~ bs(women$height, df = 5))
我们可以从中评估terms
mod
组件的必需部分
> eval(attr(mod$terms, "predvars"))
[[1]]
[1] -1.20088330 -0.46267556 -0.04791518 -1.42748340 2.32896914 0.07858849
[7] 2.16635328 -0.78670562 -1.68737883 0.71389437 -0.64123154 -0.04891306
[13] -0.07260125 0.71263717 -2.63426761
[[2]]
1 2 3 4 5
[1,] 0.000000e+00 0.000000000 0.000000000 0.000000e+00 0.000000000
[2,] 4.534439e-01 0.059857872 0.001639942 0.000000e+00 0.000000000
[3,] 5.969388e-01 0.203352770 0.013119534 0.000000e+00 0.000000000
[4,] 5.338010e-01 0.376366618 0.044278426 0.000000e+00 0.000000000
[5,] 3.673469e-01 0.524781341 0.104956268 0.000000e+00 0.000000000
[6,] 2.001640e-01 0.595025510 0.204719388 9.110787e-05 0.000000000
[7,] 9.110787e-02 0.566326531 0.336734694 5.830904e-03 0.000000000
[8,] 3.125000e-02 0.468750000 0.468750000 3.125000e-02 0.000000000
[9,] 5.830904e-03 0.336734694 0.566326531 9.110787e-02 0.000000000
[10,] 9.110787e-05 0.204719388 0.595025510 2.001640e-01 0.000000000
[11,] 0.000000e+00 0.104956268 0.524781341 3.673469e-01 0.002915452
[12,] 0.000000e+00 0.044278426 0.376366618 5.338010e-01 0.045553936
[13,] 0.000000e+00 0.013119534 0.203352770 5.969388e-01 0.186588921
[14,] 0.000000e+00 0.001639942 0.059857872 4.534439e-01 0.485058309
[15,] 0.000000e+00 0.000000000 0.000000000 0.000000e+00 1.000000000
attr(,"degree")
[1] 3
attr(,"knots")
33.33333% 66.66667%
62.66667 67.33333
attr(,"Boundary.knots")
[1] 58 72
attr(,"intercept")
[1] FALSE
attr(,"class")
[1] "bs" "basis" "matrix"
在结果列表中,第一个和第二个组件分别是响应和预测器数据。在此列表中,许多属性附加到第二个组件bs
数据。你需要提取这些。
ll <- eval(attr(mod$terms, "predvars"))
attr(ll[[2]], "knots")
attr(ll[[2]], "Boundary.knots")
> attr(ll[[2]], "knots")
33.33333% 66.66667%
62.66667 67.33333
> attr(ll[[2]], "Boundary.knots")
[1] 58 72
答案 1 :(得分:2)
你走在正确的轨道上。 mymodel$terms
包含有关模型中术语的信息,attr(mymodel$terms, "predvars")
是一个语言对象,它是具有计算结节值的预测变量列表。
要把它们拿出来:
x <- attr(mymodel$terms, "predvars")
x[[2]] # bs(LA, degree=3, knots=<vector>, Boundary.knots=<vector>, intercept=FALSE)
x[[2]]$knots
x[[2]]$Boundary.knots