使用cut -d在awk if条件中提取整行

Question

我想在制表符分隔文件中获取第11列的值。 此返回值是多个值，使用：as seperator。

example result from cat myFile | cut -d':'    :
.:7:.:2:100:.

我现在想要在：seperator上拆分此文件并检索第二个值。 这可以使用cut -d':' -f2

完成

我的问题： 如何创建一个语句，返回我的文件中第11列第二部分中值为5或更多的所有行？

输入文件（2行）：

chr1    4396745 bnd_549 a   a[chr9:136249370[   100 PASS    SVTYPE=BND;MATEID=bnd_550;EVENT=transl_inter_1022;GENE=;    GT:AD:DP:SS:SSC:BQ  .:.:.:.:.:. .:7:.:2:100:.
chr1    6315381 bnd_551 c   ]chr9:68720182]c    100 PASS    SVTYPE=BND;MATEID=bnd_552;EVENT=transl_inter_9346;GENE=;    GT:AD:DP:SS:SSC:BQ  .:.:.:.:.:. .:3:.:2:100:.

预期产出：

chr1    4396745 bnd_549 a   a[chr9:136249370[   100 PASS    SVTYPE=BND;MATEID=bnd_550;EVENT=transl_inter_1022;GENE=;    GT:AD:DP:SS:SSC:BQ  .:.:.:.:.:. .:7:.:2:100:.

输出（awk -F：'$ 11＆gt; = 5'example.sorted.vcf）： 没有输出

Answer 1

这应该有用（虽然未经测试，请提供输入和预期输出）：

awk '{split($11,ary,/:/); if(ary[2]>=5) print}' myFile

Answer 2

您还可以使用空格或冒号作为字段分隔符：

awk -F ':|[[:blank:]]+' '$23 > 5' filename