Question

我是“R”的新用户，我找不到解决它的好方法。我有以下格式的时间序列：

>dates  temperature depth   salinity
>12/03/2012 11:26   9.7533  0.48073 37.607
>12/03/2012 11:56   9.6673  0.33281 37.662
>12/03/2012 12:26   9.6673  0.33281 37.672

我的变量测量频率不规律，每15分钟或每30分钟完成一次，具体取决于时间段。我想计算每个变量的年度，月度和日均值，无论一天/月/年的数据是多少。我读了很多关于包动物园，时间序列，xts等的东西，但是我无法清楚地了解我的内容（可能因为我对R ...不够熟练）。

我希望我的帖子很清楚，如果不是，请不要犹豫告诉我。

Answer 1

将您的数据转换为xts对象，然后使用apply.daily等计算您想要的任何值。

library(xts)
d <- structure(list(dates = c("12/03/2012 11:26", "12/03/2012 11:56", 
"12/03/2012 12:26"), temperature = c(9.7533, 9.6673, 9.6673), 
    depth = c(0.48073, 0.33281, 0.33281), salinity = c(37.607, 
    37.662, 37.672)), .Names = c("dates", "temperature", "depth", 
"salinity"), row.names = c(NA, -3L), class = "data.frame")
x <- xts(d[,-1], as.POSIXct(d[,1], format="%m/%d/%Y %H:%M"))
apply.daily(x, colMeans)
#                     temperature     depth salinity
# 2012-12-03 12:26:00    9.695967 0.3821167   37.647

Answer 2

我将日，月和年添加到数据框中，然后使用aggregate()。

首先将您的date列转换为POSIXct对象：

d$timestamp <- as.POSIXct(d$dates,format = "%m/%d/%Y %H:%M",tz ="GMT")

然后将日期（例如12/03/2012）放入名为Date的列中，试试这个：

d$Date <- format(d$timestamp,"%y-%m-%d",tz = "GMT")

接下来，按日期汇总：

aggregate(cbind("temperature.mean" = temperature,
                "salinity.mean" = salinity) ~ Date,
          data = d,
          FUN = mean)

同样，您可以将月份放入一列（让我们称之为M一个月），然后......

d$M <- format(d$timestamp,"%B",tz = "GMT")

aggregate(cbind("temperature.mean" = temperature,
                "salinity.mean" = salinity) ~ M,
          data = d,
          FUN = mean)

或者如果你想要年月

d$YM <- format(d$timestamp,"%y-%B",tz = "GMT")

aggregate(cbind("temperature.mean" = temperature,
                "salinity.mean" = salinity) ~ YM,
          data = d,
          FUN = mean)

如果您的数据中包含任何NA值，则可能需要考虑以下因素：

aggregate(cbind("temperature.mean" = temperature,
                "salinity.mean" = salinity) ~ YM,
          data = d,
          function(x) mean(x,na.rm = TRUE))

最后，如果你想按周平均，你也可以这样做。首先生成周数，然后再次使用aggregate()。

d$W <- format(d$timestamp,"%W",tz = "GMT")

aggregate(cbind("temperature.mean" = temperature,
                "salinity.mean" = salinity) ~ W,
          data = d,
          function(x) mean(x,na.rm = TRUE))

此版本的周数将第1周定义为一年中第一个星期一的一周。这周是从周一到周日。

Answer 3

然而，另一种使用plyr的方法：

df <- structure(list(dates = c("12/03/2012 11:26", "12/03/2012 11:56", 
   "12/03/2012 12:26"), temperature = c(9.7533, 9.6673, 9.6673), 
   depth = c(0.48073, 0.33281, 0.33281), salinity = c(37.607, 
   37.662, 37.672)), .Names = c("dates", "temperature", "depth",                                                                                                
  "salinity"), row.names = c(NA, -3L), class = "data.frame")

library(plyr)

# Change date to POSIXct
df$dates <- with(d,as.POSIXct(dates,format="%m/%d/%Y %H:%M"))

# Make new variables, year and month
df <- transform(d,month=as.numeric(format(dates,"%m")),year=as.numeric(format(dates,"%Y")))

## According to year
ddply(df,.(year),summarize,meantemp=mean(temperature),meandepth=mean(depth),meansalinity=mean(salinity))
  year meantemp meandepth meansalinity
1 2012 9.695967 0.3821167       37.647

## According to month
ddply(df,.(month),summarize,meantemp=mean(temperature),meandepth=mean(depth),meansalinity=mean(salinity))
  month meantemp meandepth meansalinity
1    12 9.695967 0.3821167       37.647

Answer 4

包hydroTSM包含多个函数来创建年度摘要和其他摘要：

daily2annual(x, ...)
subdaily2annual(x, ...)
monthly2annual(x, ...)
annualfunction(x, FUN, na.rm = TRUE, ...)

不规则时间序列的年，月或日均值

4 个答案: