合并2个数据帧,丢弃不匹配的行

时间:2013-07-13 02:24:29

标签: r merge dataframe

我有两个数据框 - 一个是巨大的(超过200万行),另一个是较小的(大约300,000行)。较小的数据帧是较大的数据帧的子集。唯一的区别是较大的一个属性需要添加到较小的属性中。

具体地说,大数据帧的属性是(日期,时间,地址,标志),小数据帧的属性是(日期,时间,地址)。我需要以某种方式将正确的相应Flag值输入到每行的较小数据帧中。 “合并”数据帧的最终大小应与我的较小数据帧相同,从大数据帧中丢弃未使用的行。

实现这一目标的最佳方法是什么?

更新:我用以下方法测试了合并功能:

new<-merge(data12, data2, by.x = c("Date", "Time", "Address"), 
           by.y=c("Date", "Time", "Address"))

new<-merge(data12, data2, by = c("Date", "Time", "Address"))

返回具有正确数量属性的空数据框(新)以及以下警告消息:

Warning message:In `[<-.factor`(`*tmp*`, ri, value = c(15640, 15843, 15843, 15161,  : invalid factor level, NAs generated

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

    R> df1 = data.frame(a = 1:5, b = rnorm(5))
    R> df1
      a           b
    1 1 -0.09852819
    2 2 -0.47658118
    3 3 -2.14825893
    4 4  0.82216912
    5 5 -0.36285430
    R> df2 = data.frame(a = 1:10000, c = rpois(10000, 6))
    R> head(df2)
      a c
    1 1 2
    2 2 4
    3 3 5
    4 4 3
    5 5 3
    6 6 8
    R> merge(df1, df2)
      a           b c
    1 1 -0.09852819 2
    2 2 -0.47658118 4
    3 3 -2.14825893 5
    4 4  0.82216912 3
    5 5 -0.36285430 3

答案 1 :(得分:3)

也许plyr是这个操作的更直观的包。您需要的是SQL内部联接。我相信这种方法比merge()更清晰。

这是一个简单的例子,说明如何将join()用于您的大小的数据集。

library(plyr)

id = c(1:2000000)
rnormal <- rnorm(id)
rbinom <- rbinom(2000000, 5,0.5)


df1 <- data.frame(id, rnormal, rbinom)
df2 <- data.frame(id = id[1:300000], rnormal = rnormal[1:300000])

您想将rbinom添加到df2

joined.df <- join(df1, df2, type = "inner")

这是join()vs merge()

的性能
system.time(joined.df <- join(df1, df2, type = "inner"))
Joining by: id, rnormal
   user  system elapsed 
  22.44    0.53   22.80 
system.time(merged.df <- merge(df1, df2))
   user  system elapsed 
 26.212   0.605  30.201