我会尝试解释我的问题。在两个目录dir1和dir2中有365个（全局映射）文件，它们具有相同的格式，字节，扩展等。我使用下面给出的函数和代码计算了两个数据集之间的bias，如下所示：
我该如何解决这个问题呢？
答案 0 :(得分：2)
我怀疑这是由于32位系统的内存限制。您想要分配一个933M双精度数组，这需要7.6Gb的连续内存。建议您阅读?Memory和?"Memory-limits"了解详情。特别是，后者说：
错误消息开头'无法分配大小的向量'表示 无法获得内存，因为大小超过了 进程的地址空间限制，或者更可能是因为 系统无法提供内存。请注意，在32位上 建立那里可能有足够的可用内存，但不是 足够大的连续地址空间块可映射到其中 它
如果这确实是您的问题，您可以查看bigmemory包（http://cran.r-project.org/web/packages/bigmemory/index.html），它允许管理具有共享和基于文件的内存的大量矩阵。还有其他策略（例如使用SQLite数据库）来管理一次不适合内存的数据。
<强>更新即可。以下是Memory-limit对Windows的摘录：
32位Windows下的地址空间限制为2Gb，除非操作系统的默认值已更改为允许更多（最高3Gb）。请参阅http://www.microsoft.com/whdc/system/platform/server/PAE/PAEmem.mspx和http://msdn.microsoft.com/en-us/library/bb613473(VS.85).aspx。在大多数64位版本的Windows下，32位版本的R的限制是4Gb：对于最老的版本，它是2Gb。 64位版本的R（由OS强加）的限制是8Tb。
由于Windows在地址空间中间的预分配，即使在64位Windows上，通常也不可能为32位版本的R中的单个向量分配2Gb。
在Windows下，R对单个会话可用的总内存分配施加限制，因为操作系统无法执行此操作：请参阅memory.size和memory.limit。