Question

我有一个以下类型的数据框“df1”：

set.seed(2)
df1 = data.frame(Var1=rep(c('a','b','c','d'),3),
                Var2=rep(c('aa','bb','cc'),each=4),
                value=rnorm(12))

我尝试创建这个情节：

ggplot(df1) + geom_bar(aes(x=Var2,y=value),stat="identity") + facet_wrap(~Var1)

我收到以下错误消息，我不明白：

formal classes cannot be used without the methods package

怎么了？顺便说一句，我找不到一个名为方法的包。

这是我的sessionInfo（）

R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-apple-darwin10.8.0 (64-bit)

locale:
[1] fr_CH.UTF-8/fr_CH.UTF-8/fr_CH.UTF-8/C/fr_CH.UTF-8/fr_CH.UTF-8

attached base packages:
[1] utils    graphics methods  stats    base    

other attached packages:
[1] agricolae_1.1-4  reshape2_1.2.2   lattice_0.20-15  ggplot2_0.9.3.1  data.table_1.8.8

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] colorspace_1.2-2   datasets_3.0.1     dichromat_2.0-0    digest_0.6.3       grDevices_3.0.1    grid_3.0.1         gtable_0.1.2      
 [8] labeling_0.1       lme4_0.999999-2    MASS_7.3-26        Matrix_1.0-12      munsell_0.4        nlme_3.1-109       plyr_1.8          
[15] proto_0.3-10       RColorBrewer_1.0-5 scales_0.2.3       stats4_3.0.1       stringr_0.6.2      tools_3.0.1

谢谢

Answer 1

我遇到了相同的错误消息，并在不同的上下文中找到了解决方案。

在群集上运行R脚本时发生错误。有趣的是，相同的脚本在笔记本电脑上运行良好（在使用数据子集进行测试期间）。

我的上下文中的解决方案是导入用于预处理数据的包。我的意思是我以前保存了使用包＆＃34; Seurat＆＃34;创建的RDS文件。在新会话中读取RDS文件时，包＆＃34; Seurat＆＃34;在本地计算机上运行时会自动加载。但是在集群上，我必须在读取RDS文件之前使用library（）命令专门加载包。这就解决了问题，并停止了混淆的错误消息。

ggplot2：我无法理解的错误消息

1 个答案: