我正在使用Amazon Linux AMI 2013.03.1（64位）ec2实例，我通过提供ppk文件和IP地址使用putty访问它。但它将我连接到终端，有什么办法可以用GUI访问它吗？
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非常简短的回答。它不是特定于amazon linux，因为我不使用它，但应该给你足够的提示，因为它是基于Red Hat的AFAIK。
基本上你需要安装你想要使用的GUI（xfce，gnome，kde等）和vnc服务器。尝试yum search vnc和yum search gnome找出您需要安装的软件包。
然后在计算机上启动vnc服务器。您可以通过命令行控制台执行上述操作。如果它适用于您，您可以通过机器启动使VNC启动。
我不知道哪个教程对putty端口转发很有用，因为不使用windows但这对我来说很有希望：http://martybugs.net/smoothwall/puttyvnc.cgi
使用linux（也许如果您在Windows上也可以安装cygwin），通常可以使用自动端口转发启动远程vnc会话，如：
vncviewer -via <machine you try to connect> <screen number, usually :1>