我想用点扩散函数(PSF)去卷积2D图像。我已经看到有一个scipy.signal.deconvolve
函数适用于一维数组,scipy.signal.fftconvolve
可以解析多维数组。 scipy中是否有特定的函数来解卷积2D数组?
我已经定义了一个fftdeconvolve函数,用f divconvolve替换产品:
def fftdeconvolve(in1, in2, mode="full"):
"""Deconvolve two N-dimensional arrays using FFT. See convolve.
"""
s1 = np.array(in1.shape)
s2 = np.array(in2.shape)
complex_result = (np.issubdtype(in1.dtype, np.complex) or
np.issubdtype(in2.dtype, np.complex))
size = s1+s2-1
# Always use 2**n-sized FFT
fsize = 2**np.ceil(np.log2(size))
IN1 = fftpack.fftn(in1,fsize)
IN1 /= fftpack.fftn(in2,fsize)
fslice = tuple([slice(0, int(sz)) for sz in size])
ret = fftpack.ifftn(IN1)[fslice].copy()
del IN1
if not complex_result:
ret = ret.real
if mode == "full":
return ret
elif mode == "same":
if np.product(s1,axis=0) > np.product(s2,axis=0):
osize = s1
else:
osize = s2
return _centered(ret,osize)
elif mode == "valid":
return _centered(ret,abs(s2-s1)+1)
但是,以下代码在解卷和反卷后不会恢复原始信号:
sx, sy = 100, 100
X, Y = np.ogrid[0:sx, 0:sy]
star = stats.norm.pdf(np.sqrt((X - sx/2)**2 + (Y - sy/2)**2), 0, 4)
psf = stats.norm.pdf(np.sqrt((X - sx/2)**2 + (Y - sy/2)**2), 0, 10)
star_conv = fftconvolve(star, psf, mode="same")
star_deconv = fftdeconvolve(star_conv, psf, mode="same")
f, axes = plt.subplots(2,2)
axes[0,0].imshow(star)
axes[0,1].imshow(psf)
axes[1,0].imshow(star_conv)
axes[1,1].imshow(star_deconv)
plt.show()
生成的2D阵列显示在下图的下一行中。如何使用FFT反卷积恢复原始信号?
答案 0 :(得分:9)
使用来自SciPy的fftpack包的fftn,ifftn,fftshift和ifftshift的这些函数似乎有效:
from scipy import fftpack
def convolve(star, psf):
star_fft = fftpack.fftshift(fftpack.fftn(star))
psf_fft = fftpack.fftshift(fftpack.fftn(psf))
return fftpack.fftshift(fftpack.ifftn(fftpack.ifftshift(star_fft*psf_fft)))
def deconvolve(star, psf):
star_fft = fftpack.fftshift(fftpack.fftn(star))
psf_fft = fftpack.fftshift(fftpack.fftn(psf))
return fftpack.fftshift(fftpack.ifftn(fftpack.ifftshift(star_fft/psf_fft)))
star_conv = convolve(star, psf)
star_deconv = deconvolve(star_conv, psf)
f, axes = plt.subplots(2,2)
axes[0,0].imshow(star)
axes[0,1].imshow(psf)
axes[1,0].imshow(np.real(star_conv))
axes[1,1].imshow(np.real(star_deconv))
plt.show()
左下角的图像显示了上行中两个高斯函数的卷积,右下角显示了卷积效果的反转。
答案 1 :(得分:4)
请注意,除了演示目的之外,除了傅里叶域中的除法去除对任何事情都没有用。任何类型的噪音,甚至数字,都可能使你的结果完全无法使用。人们可以通过各种方式规范噪音;但根据我的经验,RL iteration更易于实施,并且在许多方面更具有物理上的合理性。