Question

在以下简短程序中：

data = []
f = open('C:/tsg3.txt', 'r').read().split("\t")

for i in range(0, len(f)-1):
   [GeneID, Sym, Alias, Xref, Chromo, Cyto, Full_name, Gene_type, Desc, Nuc_seq, Pro_seq = f[i]

我看到了ValueError的外观（需要超过4个值才能解压缩）。显然，我做错了，因为我对Python比较陌生。

任何帮助将不胜感激。我正在使用Python 3.3.2。

感谢。

Answer 1

您可以按标签拆分整个文件，从而生成一个字符串列表。

然后循环遍历该列表，将f[i]（单个字符串）分配给一长串变量。从错误消息中，您尝试为这些变量分配一个4个字符的字符串，导致分配单个字符，但由于字符数与变量数不匹配而失败。

最有可能的是，您希望处理制表符分隔的文件。使用csv module执行此类任务：

import csv

with open('C:/tsg3.txt', 'rb') as f:
    reader = csv.reader(f, delimiter='\t')
    for row in reader:
        # `row` is a list of columns.

由于该文件包含标题，您还可以使用csv.DictReader并使用词典（使用标题键入）：

with open('C:/tsg3.txt', 'rb') as f:
    reader = csv.DictReader(f, delimiter='\t')
    for row in reader:
        # `row` is a dictionary of columns.

并非所有行都包含所有值;有些似乎缺少Nucleotide_Sequence和Protein_Sequence列。

为了将来参考，您可以直接在python列表上循环，不需要使用带有range()的索引：

for i in f:
    # do something with the individual elements of `f`, assigned to `i` each iteration.

从读取的文件中解压缩值并分配给列表

1 个答案: