Question

我是第一次成立Travis-CI。我以我认为的标准方式安装scipy：

language: python
python:
  - "2.7"
# command to install dependencies
before_install:
  - sudo apt-get -qq update
  - sudo apt-get -qq install python-numpy python-scipy python-opencv
  - sudo apt-get -qq install libhdf5-serial-dev hdf5-tools
install:
   - "pip install numexpr"
   - "pip install cython"
   - "pip install -r requirements.txt --use-mirrors"
# command to run tests
script: nosetests

一切都在建立。但是当鼻子测试开始时，我得到了

ImportError: No module named scipy.ndimage

更新：以下是此问题的更直接演示。

$ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-opencv
$ python -c 'import scipy'
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>

ImportError: No module named scipy

The command "python -c 'import scipy'" failed and exited with 1 during install.

我也尝试使用pip安装scipy。我先尝试安装gfortran。 Here is one example of a failed build。有什么建议吗？

另一个更新：Travis此后添加了有关使用带有Travis的conda的官方文档。请参阅ostrokach的回答。

Answer 1

我找到了解决这个难题的两种方法：

正如@unutbu建议的那样，构建自己的虚拟环境并在该环境中使用pip安装所有内容。我让构建通过，但是从源代码安装scipy非常慢。
按照this .travis.yml file and the shell scripts that it calls中pandas项目使用的方法，强制travis使用系统范围的站点包，并使用apt-get安装numpy和scipy。这要快得多。关键线是
```
virtualenv:
    system_site_packages: true
```
在before_install组之前的travis.yml中，然后是这些shell命令
```
SITE_PKG_DIR=$VIRTUAL_ENV/lib/python$TRAVIS_PYTHON_VERSION/site-packages
rm -f $VIRTUAL_ENV/lib/python$TRAVIS_PYTHON_VERSION/no-global-site-packages.txt  
```
然后最后
```
apt-get install python-numpy
apt-get install python-scipy
```
将在nosetests尝试导入它们时找到。

<强>更新

我现在更喜欢基于conda的构建，这比上述任何一种策略都要快。这是我维护的项目的one example。

Answer 2

官方conda文档中对此进行了介绍：Using conda with Travis CI。

.travis.yml文件

以下显示了如何修改.travis.yml文件以使用Miniconda来支持Python 2.6,2.7,3.3和3.4的项目。

注意：有关basic configuration for Travis。
的信息，请参阅Travis CI网站

language: python
python:
  # We don't actually use the Travis Python, but this keeps it organized.
  - "2.6"
  - "2.7"
  - "3.3"
  - "3.4"
install:
  - sudo apt-get update
  # We do this conditionally because it saves us some downloading if the
  # version is the same.
  - if [[ "$TRAVIS_PYTHON_VERSION" == "2.7" ]]; then
      wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh -O miniconda.sh;
    else
      wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O miniconda.sh;
    fi
  - bash miniconda.sh -b -p $HOME/miniconda
  - export PATH="$HOME/miniconda/bin:$PATH"
  - hash -r
  - conda config --set always_yes yes --set changeps1 no
  - conda update -q conda
  # Useful for debugging any issues with conda
  - conda info -a

  # Replace dep1 dep2 ... with your dependencies
  - conda create -q -n test-environment python=$TRAVIS_PYTHON_VERSION dep1 dep2 ...
  - source activate test-environment
  - python setup.py install

script:
  # Your test script goes here

Answer 3

我发现这种方法有效：

http://danielnouri.org/notes/2012/11/23/use-apt-get-to-install-python-dependencies-for-travis-ci/

将这些行添加到Travis配置中，以virtualenv与--system-site-packages一起使用：

virtualenv:
  system_site_packages: true

您可以在apt-get部分通过before_install安装Python软件包，并在您的virtualenv中使用它们：

before_install:
 - sudo apt-get install -qq python-numpy python-scipy

可以在nolearn中找到这种方法的实际用途。

Answer 4

正如Dan Allan在他的更新中指出的，他现在更喜欢基于conda的构建。 Here is a gist由Dan Blanchard提供完整的.travis.yml文件示例，该示例将在测试计算机上预安装scipy：

language: python
python:
  - 2.7
  - 3.3
notifications:
  email: false

# Setup anaconda
before_install:
  - wget http://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda-latest-Linux-x86_64.sh -O miniconda.sh
  - chmod +x miniconda.sh
  - ./miniconda.sh -b
  - export PATH=/home/travis/miniconda/bin:$PATH
  - conda update --yes conda
  # The next couple lines fix a crash with multiprocessing on Travis and are not specific to using Miniconda
  - sudo rm -rf /dev/shm
  - sudo ln -s /run/shm /dev/shm
# Install packages
install:
  - conda install --yes python=$TRAVIS_PYTHON_VERSION atlas numpy scipy matplotlib nose dateutil pandas statsmodels
  # Coverage packages are on my binstar channel
  - conda install --yes -c dan_blanchard python-coveralls nose-cov
  - python setup.py install

# Run test
script:
  - nosetests --with-cov --cov YOUR_PACKAGE_NAME_HERE --cov-config .coveragerc --logging-level=INFO

# Calculate coverage
after_success:
  - coveralls --config_file .coveragerc

travis-ci上的scipy ImportError

4 个答案:

`.travis.yml`文件

travis-ci上的scipy ImportError

4 个答案:

.travis.yml文件

`.travis.yml`文件