我有一组数据,其中包含大约150,000个800个科目的观察结果。每个观察具有:主题ID,纬度,经度以及主题在那些坐标处的时间。数据涵盖24小时。
如果我一次绘制所有数据,我只会得到一个blob。是否有人能够给我一些关于如何为这些数据设置动画的提示,以便我可以观察到主体的路径随时间的变化?
我已经阅读过时空小插曲,但我并不完全确定它会做我想要的。在这一点上,我花了很多时间在谷歌搜索,但没有真正想出任何符合我需要的东西。
任何提示和指示都非常感谢!
答案 0 :(得分:3)
这是我第一次使用animation
包。这比我预想的要容易,特别是saveHTML
真是太棒了。在这里我的场景(即使我认为我的R代码会更清楚:)
saveHTML
函数中。
这是我的代码:
library(animation)
library(ggplot2)
library(grid)
## creating some data of hours
N.hour <- 24
dat <- data.frame(person=rep(paste0('p',1:3),N.hour),
lat=sample(1:10,3*N.hour,rep=TRUE),
long=sample(1:10,3*N.hour,rep=TRUE),
time=rep(1:N.hour,each=3))
# the base plot with
base <- ggplot() +
geom_point(data=dat,aes(x=lat, y=long,colour = person),
size=5)+ theme(legend.position = "none")
## reshape data to lat and long formats
library(plyr)
dat.segs <- ddply(dat,.(person),function(x){
dd <- do.call(rbind,
lapply(seq(N.hour-1),
function(y)c(y,x[x$time %in% c(y,y+1),]$lat,
x[x$time %in% c(y,y+1),]$long)))
dd
})
colnames(dat.segs) <- c('person','path','x1','x2','y1','y2')
# a function to create the animation
oopt <- ani.options(interval = 0.5)
saveHTML({
print(base)
interval = ani.options("interval")
for(hour in seq(N.hour-1)){
# a segment for each time
tn <- geom_segment(aes(x= x1, y= y1, xend = x2,
yend = y2,colour = person),
arrow = arrow(), inherit.aes = FALSE,
data =subset(dat.segs,path==hour))
print(base <- base + tn)
ani.pause()
}
}, img.name = "plots", imgdir = "plots_dir",
htmlfile = "random.html", autobrowse = FALSE,
title = "Demo of animated lat/long for different persons",
outdir=getwd())
答案 1 :(得分:1)
你的问题有点模糊,但我会分享我过去做过这种动画的方式。
创建一个绘制一个时间片的所有主题位置的函数:
plot_time = function(dataset, time_id) {
# make a plot with your favorite plotting package (e.g. `ggplot2`)
# Save it as a file on disk (e.g. using `ggsave`), under a regular name,
# frame001.png, frame002.png, see sprintf('frame%03d', time_index)
}
在每个时间片上调用此函数,例如使用lapply
:
lapply(start_time_id:stop_time_id, plot_time)
导致名为frame001
到framexxx
的硬盘驱动器上的一组图形文件。
使用工具将这些帧渲染为电影,例如使用ffmpeg
,请参阅for example。
这是一个常规工作流程,已在animation
包中实现(感谢提醒我@mdsummer)。您可以利用该包来获取动画。