Question

我对如何在R中将事物合并在一起的常见问题有所不同。

我在特定文件夹中有一组.txt文件，我编写了一个函数：

列出我想要的文件，然后列出每个文件
读取文件
对数据进行子集化（仅提取感兴趣的行和列）
对数据进行一些计算
将这些新值添加到列表中。

我最终得到的是一个具有以下结构的列表：

>str(DataList)
List of 16
 $ :'data.frame':   14 obs. of  2 variables:
  ..$ Sample: Factor w/ 14 levels "Sample_1A","Sample_1B",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
  ..$ Var1  : num [1:14] 27.9 33.8 29.9 29.4 28.8 ...
 $ :'data.frame':   14 obs. of  2 variables:
  ..$ Sample: Factor w/ 14 levels "Sample_1A","Sample_1B",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
  ..$ Var2  : num [1:14] 24.6 27 26.8 26.7 27.2 ...
 $ :'data.frame':   12 obs. of  2 variables:
  ..$ Sample: Factor w/ 14 levels "Sample_1A","Sample_1B",..: 1 2 3 4 5 6 7 9 11 12 ...
  ..$ Var3  : num [1:12] 31.4 35.6 34 35.7 32.5 ...

对于每个变量（Var1, Var2, Var3, ...），我有一列Sample和一列数值。

Sample始终是14个级别的因素;这些级别对于每个变量都是相同的。

问题是某些变量（如上面的Var3）没有对Sample的每个级别进行观察。

我最终想要的是一个包含14行的数据框（每个级别为Sample一个）。第一列应为Sample;那么对于每个变量，应该有一个包含相应数值的列，如下所示：

Sample     Var1    Var2    Var3
Sample_1A  27.9    24.6    31.4
Sample_1B  33.8    27      35.6
...
Sample_3B  26.8    29.7    NA

我一直在尝试使用do.call执行此操作，但不知道如何传递by的参数;由于缺少值，cbind会感到不快。有关如何做到这一点的任何想法？

谢谢！

编辑：根据乔兰的要求：

>dput(DataList[1:3])
list(structure(list(Sample = structure(1:14, .Label = c("Sample_1B", "Sample_1C", "Sample_1D", "Sample_2C", "Sample_2A", "Sample_2D", "Sample_3B", "Sample_3C", "Sample_3A", "Sample_3D", "Sample_4B", "Sample_4C", "Sample_4A", "Sample_4D"), class = "factor"), Var1 = c(26.9333333333333, 29.17, 28.9366666666667, 28.9233333333333,  28.61, 28.63, 26.7933333333333, 34.6633333333333, 30.4966666666667, 28.4433333333333, 27.4533333333333, 28.3, 27.9633333333333, 27.2366666666667)), .Names = c("Sample", "Var1"), row.names = c(NA, -14L), class = "data.frame"), structure(list(Sample = structure(1:14, .Label = c("Sample_1B",  "Sample_1C", "Sample_1D", "Sample_2C", "Sample_2A", "Sample_2D", "Sample_3B", "Sample_3C", "Sample_3A", "Sample_3D", "Sample_4B", "Sample_4C", "Sample_4A", "Sample_4D"), class = "factor"),                                       Var2 = c(24.19, 26.6033333333333, 26.0366666666667, 27.6766666666667, 27.61, 27.5633333333333, 25.1566666666667, 33.7266666666667, 27.7, 26.1466666666667, 25.65, 26.3633333333333, 25.5333333333333, 26.1733333333333)), .Names = c("Sample", "Var2"), row.names = c(NA,  -14L), class = "data.frame"), structure(list(Sample = structure(c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 9L, 11L, 12L, 13L, 14L), .Label = c("Sample_1B", "Sample_1C", "Sample_1D", "Sample_2C", "Sample_2A", "Sample_2D", "Sample_3B", "Sample_3C", "Sample_3A", "Sample_3D", "Sample_4B", "Sample_4C", "Sample_4A", "Sample_4D"), class = "factor"), Var3 = c(31.4133333333333, 35.56, 33.9666666666667, 35.66, 32.4633333333333, 31.99, 31.3133333333333, 36.34, 34.9433333333333, 34.5433333333333, 34.3766666666667, 33.28)), .Names = c("Sample",  "Var3"), row.names = c(NA, -12L), class = "data.frame"))

Answer 1

看起来像是Reduce的教科书用例。

merge.all <- function(x, y) {
    merge(x, y, all=TRUE, by="Sample")
}

output <- Reduce(merge.all, DataList)

R - 将数据帧列表合并为一个数据帧，并按行丢失值

1 个答案: