在子目录中构建共享库

时间:2013-06-16 12:54:19

标签: c r makefile

我正在尝试构建一个使用一些C代码的R包。我有一个C库,它被编译成可执行文件,可以从命令行调用。有一个与之关联的Makefile。

我正在尝试查看信息here,其中包含

  

如果您想创建然后链接到库,请说使用代码   子目录,使用类似

的东西
 .PHONY: all mylibs

 all: $(SHLIB)
 $(SHLIB): mylibs

 mylibs:
         (cd subdir; make) 
  

小心创建所有必需的依赖项,因为没有   保证所有的依赖关系   将以特定顺序(以及一些CRAN构建机器)运行   使用多个CPU并行并行。)

如果我在我的包中创建一个src文件夹的新子目录,名为someLibrary,代码和Makefile保持不变,反过来,在原始的Makevars文件中为我包我添加上面的代码不变,那么我将能够使用useDynLib构建要导出的共享库吗?


编辑1:

以下信息here,我通过添加

更改了Makefile以创建共享库
CFLAG = -fPIC -g -O3 
LDFLAGS= -shared

但是,这会导致.so文件不直接导出到包的libs目录的问题。如果我将路径硬编码到目标中,那么文件将被发送到包的libs目录(这完全取决于对R CMD INSTALL myPackage的调用)。


编辑2:

最后,我想知道如何调用共享库,因为它有一个main()方法,我可以从命令行可执行文件调用。

将此公开给R NAMESPACE的程序是什么,以便可以通过.Call调用?

PS。如果我将最后一点作为一个单独的问题,请告诉我。

2 个答案:

答案 0 :(得分:13)

原始问题作者在问题评论中询问了使用 Automake Libtool LDADD链接编译的程序的示例一个目录,其中包含在第二个目录中编译的共享库。 这是一个完整,独立,完整的示例,说明如何使用GNU Autotools在同一源代码树的不同目录中编译库和程序。

目录结构

我们需要按如下方式设置目录结构:

├ A/
│ ├ Makefile.am
│ ├ helloworld.c
│ └ helloworld.h
├ B/
│ ├ Makefile.am
│ └ foo.c
├ configure.ac
└ Makefile.am

共享库将在目录A/中编译,以及在目录B/中使用它的程序。

编写源代码

有三个源文件。

A/helloworld.c是该库的源代码。它导出一个过程say_hello(),它打印消息“Hello world!”到标准输出。

#include <stdio.h>
#include "helloworld.h"

void
say_hello (void)
{
  printf ("Hello world!\n");
}

A/helloworld.h是包含say_hello()函数声明的头文件。它只有一行:

void say_hello (void);

最后,B/foo.c是使用共享库的程序的源代码。它包含库的头文件,并调用say_hello()

#include <helloworld.h>

int
main (int argc, char **argv)
{
  say_hello ();
  return 0;
}

编译库

我们将使用Automake和Libtool来编译共享库。这两种工具都非常强大,而且实际上有很好的文档记录。手册(AutomakeLibtool)绝对值得一读。

A/Makefile.am automake文件用于控制库的编译。

# We're going to compile one libtool library, installed to ${libdir},
# and named libhelloworld.
lib_LTLIBRARIES = libhelloworld.la

# List the source files used by libhelloworld.
libhelloworld_la_SOURCES = helloworld.c

# We install a single header file to ${includedir}
include_HEADERS = helloworld.h

编译程序

B/Makefile.am文件控制库的编译。我们需要使用LDADD变量告诉automake链接我们之前编译的库。

# Compile one program, called foo, and installed to ${bindir}, with a single C
# source file.
bin_PROGRAMS = foo
foo_SOURCES = foo.c

# Link against our uninstalled copy of libhelloworld.
LDADD = $(top_builddir)/A/libhelloworld.la

# Make sure we can find the uninstalled header file.
AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/A

控制构建

最后,我们需要一个顶级Makefile.am告诉Automake如何构建项目,以及configure.ac文件告诉Autoconf如何找到所需的工具。

顶级Makefile.am非常简单:

# Compile two subdirectories.  We need to compile A/ first so the shared library is
# available to link against.
SUBDIRS = A B

# libtool requires some M4 scripts to be added to the source tree.  Make sure that
# Autoconf knows where to find them.
ACLOCAL_AMFLAGS = -I m4

最后,configure.ac文件告诉Autoconf如何创建configure脚本。

AC_INIT([libhelloworld], 1, peter@peter-b.co.uk)

# This is used to help configure check whether the source code is actually present, and
# that it isn't being run from some random directory.
AC_CONFIG_SRCDIR([A/helloworld.c])

# Put M4 macros in the m4/ subdirectory.
AC_CONFIG_MACRO_DIR([m4])

# We're using automake, but we want to turn off complaints about missing README files
# etc., so we need the "foreign" option.
AM_INIT_AUTOMAKE([foreign])

# We need a C compiler
AC_PROG_CC

# Find the tools etc. needed by libtool
AC_PROG_LIBTOOL

# configure needs to generate three Makefiles.
AC_CONFIG_FILES([A/Makefile
                 B/Makefile
                 Makefile])
AC_OUTPUT

测试

执行命令

$ autoreconf -i
$ ./configure
$ make
$ B/foo

您应该看到所需的输出:“Hello world!”

答案 1 :(得分:2)

callable.c

#include <stdio.h>

int main(int argc, char **argv) {
    printf("Hello World\n");
    return 0;
}

要从C文件callable.c获取.so文件,请使用

R CMD SHLIB callable.c

所以现在我们有callable.so

R通常要求所有C参数都是指针,但如果你的main方法忽略了argc,那么我们可以解决这个问题。因此,要从R调用main来自callable.so,我们可以编写一个类似的方法。

main <- function() {
    dyn.load("callable.so")
    out <- .C("main", argc=0, argv="")
}

调用main函数将运行C main函数。