使用稀疏矩阵和glmnet时出现奇怪的错误

Question

在训练glmnet回归时，我遇到了一个奇怪的错误。

invalid class "dgCMatrix" object: length(Dimnames[[2]])' must match Dim[2] 

它只是偶尔发生，也许只在较大的数据集下发生。

我不确定在给定某个数据集的情况下它是否一致。

任何线索？

Answer 1

在不知道这些软件包的细节的情况下，John Chambers“Software for Data Analsys”（2008，Springer）对调试进行了很好的讨论，例如通过

> options(error=recover) 

这可能会有所帮助。

Answer 2

我在使用family ='binomial'时遇到了同样的错误。事实证明，我的响应变量中的事件/案例太少了。在cv.glmnet中使用nfold = 10，如果我的二进制响应[0,1]发生的时间少于〜2％，我会得到错误。我建议您使用脚本检查此方案，并在true时使用glmnet。尽管选择lambda，你将无法获得x验证的好处。

Answer 3

需要澄清以上内容。使用cv.glmnet（）时遇到了这个问题。通过识别那些案例太少的实例，我使用glmnet（）代替。你失去了交叉验证的好处（即估计lambda），但它会失败。